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目的基因验证 课件
目的基因验证
酶切验证方向
Sense
Anti-sense
Promoter
Promoter
Coding sequence
Coding sequence
NOS
NOS
双酶切
单酶切
酶切位点的选择
1、载体上有,目的片段内部也有,但最好都分别只有一个位点;
2、目的片段上的酶切位点不要位于片段中央附近,要选取能够区分大小的位点;
1、用连接的两种酶验证;2、参照单酶切。
酶切验证方向的方法很灵活多变,具体情况具体分析。
pCxsn-PtWRKY60的方向验证
ATGGATGTCTTTCCCTCTTGCAAAGAAAAGGTGGAAGCTCTTCAATTCGAGTTGGAACACAGGCAGAAAGAGAATGAAAGTCTTAGATTTATGCTTGGAGTTATGACCAGAAGATTCAGCATTCTTCAAGCCGAGATTCAAGAAACCGAAGAACATCAACAAAAGACAGCTAGCAACTTAGCGGATGGAGATCAAGCTTGTCATGAAATCCTTGACTCGAACAAGAGAGCAAGATTTGAAGTTCCCATAACCAAGGCATCGAGAATCTTGGTGAGAAGTCACTCCAATGACAAGAGCCTGATTGTGAAAGATGGATATCAATGGAGAAAGTATGGCCAGAAGGTTACTAAGGATAACCCATCACCTCGAGCTTACTTCAGGTGTTCCATGGCTCCTAATTGCCCCGTCAAGAAGAAGGTCCAAAGATGTGTAGAAGATGATTCAGTACTTGTTGCAAGCTATGATGGAGAACACAACCATGAACCCAATGGTTCACATGGACAATATTTATGTTCTCCACATACCTCATCATCAAAAATTTCCATAACTAATCATGTCCTCAAGTGTCCAATCGAAATTCCTCCTCTTCAACCATCTATAGCTCTTGATCTTACTCTTTCAAGTCCCAGTAATCAACAGAAGGAAAATCCTTCTAAAAGATCCATGGAAGACTGCGGCAAGATTAATAATAACTGCAACAAGAACTACATTGAAGAATATGTGGCATCTTTAACTAAAGATCCTACCTTCTCTGTAGCTTTAGCTGCGGCTGTTGCAAGTTCAATGAGTGACCTGTCTTCGTCAAGAATGCTGTGA
PtWRKY60 CDS序列
pCxsn载体
NEBcutter分析片段上的酶切位点
10ul体系酶切pCxsn-PtWRKY60
Plasmid: 8.75ul;
M buffer: 1ul;
HindIII: 0.25ul.
37℃水浴2-3h
1541bp
1117bp
AS
S
测序
测序的样本可以为:菌液、质粒、PCR产物、其他;
测序要提供测序引物;
一次反应大约可测800bp的长度,如果目的片段超过这一长度可以选择测通、双向,或者是单向walking等方法。
测序单
测序结果
波峰信号
序列信息
序列信息
测序结果和原序列比对结果
Identity=98.22%
波峰信号
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