目的基因验证 课件.ppt

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目的基因验证 课件

目的基因验证 酶切验证方向 Sense Anti-sense Promoter Promoter Coding sequence Coding sequence NOS NOS 双酶切 单酶切 酶切位点的选择 1、载体上有,目的片段内部也有,但最好都分别只有一个位点; 2、目的片段上的酶切位点不要位于片段中央附近,要选取能够区分大小的位点; 1、用连接的两种酶验证;2、参照单酶切。 酶切验证方向的方法很灵活多变,具体情况具体分析。 pCxsn-PtWRKY60的方向验证 ATGGATGTCTTTCCCTCTTGCAAAGAAAAGGTGGAAGCTCTTCAATTCGAGTTGGAACACAGGCAGAAAGAGAATGAAAGTCTTAGATTTATGCTTGGAGTTATGACCAGAAGATTCAGCATTCTTCAAGCCGAGATTCAAGAAACCGAAGAACATCAACAAAAGACAGCTAGCAACTTAGCGGATGGAGATCAAGCTTGTCATGAAATCCTTGACTCGAACAAGAGAGCAAGATTTGAAGTTCCCATAACCAAGGCATCGAGAATCTTGGTGAGAAGTCACTCCAATGACAAGAGCCTGATTGTGAAAGATGGATATCAATGGAGAAAGTATGGCCAGAAGGTTACTAAGGATAACCCATCACCTCGAGCTTACTTCAGGTGTTCCATGGCTCCTAATTGCCCCGTCAAGAAGAAGGTCCAAAGATGTGTAGAAGATGATTCAGTACTTGTTGCAAGCTATGATGGAGAACACAACCATGAACCCAATGGTTCACATGGACAATATTTATGTTCTCCACATACCTCATCATCAAAAATTTCCATAACTAATCATGTCCTCAAGTGTCCAATCGAAATTCCTCCTCTTCAACCATCTATAGCTCTTGATCTTACTCTTTCAAGTCCCAGTAATCAACAGAAGGAAAATCCTTCTAAAAGATCCATGGAAGACTGCGGCAAGATTAATAATAACTGCAACAAGAACTACATTGAAGAATATGTGGCATCTTTAACTAAAGATCCTACCTTCTCTGTAGCTTTAGCTGCGGCTGTTGCAAGTTCAATGAGTGACCTGTCTTCGTCAAGAATGCTGTGA PtWRKY60 CDS序列 pCxsn载体 NEBcutter分析片段上的酶切位点 10ul体系酶切pCxsn-PtWRKY60 Plasmid: 8.75ul; M buffer: 1ul; HindIII: 0.25ul. 37℃水浴2-3h 1541bp 1117bp AS S 测序 测序的样本可以为:菌液、质粒、PCR产物、其他; 测序要提供测序引物; 一次反应大约可测800bp的长度,如果目的片段超过这一长度可以选择测通、双向,或者是单向walking等方法。 测序单 测序结果 波峰信号 序列信息 序列信息 测序结果和原序列比对结果 Identity=98.22% 波峰信号 谢 谢!

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