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Image Pro Plus教程 中文版 快速入门精品
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分析测量图象软件 Imagepro-Plus 教程
一、入门
Imageproplus (IPP)的主要用途是分析测量图象。本人使用该程序进行生物图象分析有
一段时间,写此帖的主要目的还是与大家交流使用心得,并总结一下使用方法。
如果你是刚接触IPP,最好先从本帖看起,并同时打开你电脑上的IPP程序照着操作。学会
一个软件需要花一段时间的,两分钟不可能学会。两小时也太短。但我相信,照着我这几
个帖子作下来,至少是可以用IPP干一点事情了。
打开IPP后的界面是这样的,该从何处下手呢?
既然是处理图片,当然是先要打开一张要处理的图片嘛
这张照片中的黄色部分是免疫组化染色的阳性表达成分。处理目标是通过测量图片中黄色
部分的黄度来反映相应蛋白表达的的“量” 。对该图片进行观察,可以看到图片中主要有三
种主要颜色,一是染成蓝色的细胞核,二是呈现出黄色的胞浆,三是细胞间的空隙区域,
所以首先要把图片中呈现黄色的区域给挑选出来,这部分区域是我们最感兴趣的地方,叫
作AOI (area of interest )。AOI是IPP中最有用最重要的概念。如何能够准确地选取AOI就
是使用IPP的关键操作。一旦准确地选取了AOI ,下面的测量分析就好办了。对不同的图
片,需灵活地使用各种适当的AOI工具,就这张图片来说,AOI是黄色区域,因此用颜色分
类的AOI工具是最有效的。点击measurecount/size,弹出分类测量窗口
在窗口中选中manual,再点击select color,弹出颜色选择窗口segmentation,这个工具是
IPP最有特色的颜色选取工具之一。用好这个工具是使用IPP的要点。
对于目标颜色鲜明的图片,用吸管工具是最简单的。点一下吸管图标,在目标区域点一
下,就可以选中该点的颜色,当然一下是不可能完全选中所需要指定的全部区域,可以在
未选中的地方接着再点,这样多次选取,直到把想选中的区域全部选中为止。在这张示例
图中,选中的蓝色细胞核部分被标上了红色。用红框圈起来的四个工具按纽分别是:吸
管、撒消上一步操作、橡皮擦、全部清除。下在的小方框里则是吸管位置的选取颜色。
图片中被标上红色的区域被定义为一个class,其中每一个独立的小区块被定义为这个
class中的一个object 。以此图为例,图中深蓝色的部分是细胞核,因此所有的细胞核都被
选中成一个class,其中每一个细胞核就是一个object 。
选取完AOI后,点击close回到count/size窗口,下一步就可以对选中的object进行测量操作
了。
点击count/size窗口中的measure菜单,点select measure,这是选择要进行何种测量操
作,在弹出的测量选择窗口左侧列出了各种可用的测量选项,最常用的测量有:
area面积
density (mean)平均光密度
diameter直径
IOD (integrated optical density)累积光密度
在相应的项目上点一下,该测量项目就被选到中间的窗口中了,同时关于该测量的详细说
明会显示在最右边。如果想取消某个已选中的测量项目,则在左边窗口中该项目上再点击
一下就可以了。
选好了待测量的区域,也指定了测量项目,就可以进行测量统计了,点击一下测量选择窗
口的OK纽,关闭这个窗口,就回到了count/size窗口,再点击一下count按纽,就可以看到
程序在进行测量,稍等几秒钟即可读取测量数据。
分别点击count/size窗口中view菜单中的measurement data和statistics,就分别弹出这两
个数据窗口。前者是这个calss中每一个object的测量数据,后者是这些测量数据的统计参
数,如总数、平均值、累加、标准差等。本例中得到的就是每个细胞核的面积、平均光密
度值、直径、累积光密度值。统计数据则可得到这张图片中所有细胞核的平均面积、平均
光密度值,平均直径、累积光密度值,当然还有细胞核的数目,就是所有object的数目。
测量数据转入EXCEL处理起来最方便。只要在数据菜单中点file - DDE to EXCEL 。数据就
传到EXCEL的sheet1 里去了。
在这个示例图片的统计数据中,samples为图中所有细胞
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