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RNA提取过程
RNA提取步骤及注意事项
实验步骤如下:
1.取50—100mg的组织,加入1ml Trizol试剂,用匀浆器打匀(Trizol先放于冰上)。
2.将匀浆室温放置5min。
3.加入00μl氯仿,剧烈震荡混匀30s,冰上静置min。
4.12000rpm,4离心15min。
5.将上清液小心转移到新的1.5ml离心管中(取400μl),加入等量体积的异丙醇,上下颠倒几次混匀,室温下放置15min。(此步中注意:不要吸取任何中间层物质,宁缺勿烂。)
6.12000rpm,4离心15min。
7.小心移去上清液,防止RNA沉淀丢失。
8.用70%乙醇(DEPC处理的水配制)洗涤1次,加入700μl乙醇,将RNA沉淀弹起,漂洗。(此时RNA是不溶解的)
9.000rpm,室温离心10min。
10.尽可能彻底地吸走上清,防止RNA沉淀丢失。
11.真空离心干燥3—5分钟,或放在室温下使乙醇完全挥发掉。
12.沉淀用0μl DEPC-H2O溶解。如发现沉淀难溶,68处理10min。
13.RNA检测
(1)测定样品在260nm和280nm的吸光值按1OD=40μg/ml RNA计算RNA的产量。
OD260/OD280在1.8-2.0。
(2)进行甲醛变性琼脂糖凝胶电泳,确定RNA的完整性和污染情况。
注意事项:
??? 1.获得RNA效率低有一下原因
????? a:样品裂解或匀浆处理不彻底
????? b:最后得到地RNA沉淀未完全溶解
??? 2.A260/A280
????? a:检测吸光度时,RNA样品不是溶于TE,而是溶于水。低离子浓度和低PH条件下,A280值会较高
????? b:样品匀浆时加地试剂量太少
????? c:匀浆后样品未在室温放置2分钟
????? d:水相中混有有机相
????? e:最后得到地RNA沉淀未完全溶解
??? 3.RNA降解原因
????? a:组织取出后没有马上处理或冷冻
????? b:样品或提取地RNA沉淀保存于-5--20度,未在-60--70度保存
????? c:细胞在胰酶处理时被破坏
????? d:溶液或离心管未经RBase去处理
反转录成cDNA第一链在20ul体系中,加入ul总RNA, 1 ul oligo dT 70°c温育10分钟后立即冰浴冷却,继续加入4ul 5 x Buffer, 2ul ul IOMm dNTPs ( IOMm/种),混匀后于42保温2分钟,加入1ul( 200U)的反转录酶,42继续温育0分钟。70C 10分钟灭活反转录酶。
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