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同源域亮氨酸拉链HD-Zip转录因子-abc
同源域亮氨酸拉链同源域亮氨酸拉链 ((HDHD-ZipZip ))
转录因子转录因子
郑旭郑旭
CAAS08F2-E
孟颖颖孟颖颖潘娜潘娜李岩强李岩强别小敏别小敏成果成果于幅宽于幅宽任旭任旭姜晓东姜晓东
2009-3-12 1
CConttentts
背景
方法
结果分析结果分析
2009-3-12 2
IntroductionIntroduction
11. 同源结构域亮氨酸拉链转录因子的发现同源结构域亮氨酸拉链转录因子的发现
同源结构域(HOMEODOMAIN )转录因子从果蝇
到人广泛存在到人广泛存在。此后此后,利用该因子的保守区段作利用该因子的保守区段作
为探针,在拟南芥中筛选到两个基因。进一步的
分析发现其后紧挨分析发现其后紧挨一个亮氨酸拉链结构域个亮氨酸拉链结构域 ((IdaIda
Ruberti ,The EMBO Journal,1991)。
随后随后MARKMARK SCHENASCHENA等利用同源结构域作等利用同源结构域作
探针,在拟南芥cDNA文库中筛选到8个基因,紧
挨其后都含有一个亮氨酸拉链结构域(MARK
SCHENA 等,Proc. Natl. Acad. Sci ,1992)。说
明HD-Zip转录因子在拟南芥中广泛存在。
2009-3-12 3
22. HDHD-ZiZip的研究现状的研究现状
到目前只有在拟南芥中的研究较为深入到目前只有在拟南芥中的研究较为深入,
发现该基因家族会迅速应答对外界环境的变
化,如光照,干旱及激激素。
2009-3-12 4
MMeththodds
HD-Zip序列的获取
http://
htthttp:////
(E(E vallue11e-5)5)
进化及蛋白结构分析
• ClClusttall WW
• Tree-Puzzle 5.2(ML)
2009-3-12 5
PHYLIP(v3.6) and MEGA [NJMP]
StructureStructure andand motifmotif analysisanalysis
• /
• htthttp:////meme.sddsc.eddu//meme//
2009-3-12 6
RResultlts
HDHD-ZipZip序列的筛选鉴定
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