芽胞杆菌种类脂肪酸鉴定与分子鉴定方法的比较推荐.doc

目 录 芽胞杆菌种类脂肪酸鉴定与分子鉴定方法的比较 1 福建茶园土壤菊酯类农药调查 13 柑橘木虱成虫过冷却点及结冰点的测定(1月份) 19 不同致病性青枯雷尔氏菌发酵液紫外扫描 23 短短芽孢杆菌FJAT-0809-GLX的基因预测及基因注释 28 酶解后BT、BTA与小菜蛾BBMVs的相互作用的研究 34 漳州香蕉枯萎病株体内细胞壁降解酶的比较 40  芽胞杆菌种类脂肪酸鉴定与分子鉴定方法的比较 刘国红1，2，林营志1, 刘波 （1 福建省农业科学院农业生物资源研究所，350003；2 福建农林大学, 350002） 摘要：芽胞杆菌在自然界中分布广泛，因此芽胞杆菌也具有悠久的研究历史，但是其分类地位一直处于变化之中。为了寻找一种简单快速的分类手段，本文基于ITS序列和脂肪酸鉴定方法对从土壤中分离得到的16株芽胞杆菌进行分类研究，与分子鉴定结果相比，脂肪酸种的鉴定准确率可达到99%以上。通过生物软件SPSS和Mega分别对16株菌进行聚类分析，结果表明脂肪酸比ITS更适合于芽胞杆菌的分类研究，本根据脂肪酸成分可以将16株芽胞杆菌准确的聚在一起，而ITS则不能。芽胞杆菌特征性脂肪酸为15:0 ANTEISO和15:0 ISO，但不同种芽胞杆菌的此类脂肪酸含量不同。本文选取芽胞杆菌三大类菌群主要特征性脂肪酸的含量比例（15:0ISO/15:0 ANTEISO）进行了分析。其中比较特殊的为蜡状芽胞杆菌类群，蜡状芽胞杆菌主要脂肪酸为15:0ISO，其次为13:0ISO，而15:0 ANTEISO的含量很低非主要类型，15:0ISO/15:0 ANTEISO的比值约为5.6-7.9。简单芽胞杆菌群主要脂肪酸为15:0 ANTEISO和15:0ISO， 15:0ISO/15:0 ANTEISO 比值约为1/6左右。巨大芽胞杆菌类群主要脂肪酸15:0ISO和15:0 ANTEISO含量相近，其余脂肪酸远远低于这两种主要脂肪酸。巨大芽胞杆菌的15:0ISO/15:0 ANTEISO 的比值为约4/5-5/4，菌株4500为短小芽胞杆菌，其15:0ISO/15:0 ANTEISO比值约为2。短小芽胞杆菌和巨大芽胞杆菌脂归为一类是因为其脂肪酸类型相近，但含量并不同。枯草芽胞杆菌群主要脂肪酸15:0ISO的含量小于15:0 ANTEISO，15:0ISO/15:0 ANTEISO 的比值为1/3-2/3。综上所述，根据以上所述，芽胞杆菌主要脂肪酸含量和类型可以快速地初步判断未知菌株属于哪个类群，表明脂肪酸鉴定可以成为一种快速、有效、简单的芽胞杆菌分类鉴定方法。 关键词：芽胞杆菌；脂肪酸类型；ITS序列；分类 Comparison of Bacillus species identification based on ITS and fatty acid analysis Guohong Liu1,2, Yingzhi Lin1, Bo Liu1 （1Fujian Academy of Agricultural Sciences, 35003; 2 Fujian Agriculture and Forestry University, 350002） Abstract: Bacillus species are widely distributed in nature. Although the study of genus Bacillus has a long history, its taxonomic status has been in changes. In order to find out a simple and rapid means for identification, 16 strains of Bacillus species isolated from soil were studied based on ITS sequences and fatty acids analysis. FA Identification results accuracy rate was 99%. Through biological software of SPSS and Mega cluster analysis, fatty acids were found to be better for Bacillus identification than ITS sequences. In this paper, we could make all the strains cluster together, by FA, but ITS could not. The major fatty acid of genus Ba