应用au和np20芯片对大肠癌患者血清标志物的筛选比较分析及联合诊断模型的构建-生物化学与分子生物学专业论文.docx

东华大学硕士论文主要中英文缩写检索表英文缩写英文全称中文名称C R CC olo reetalC aneer结直肠癌N P20N o rm alPhase 20正相亲水芯片AU (AF358)Gold ChiP(AF358)金芯片TFATrifluoroaeetieA eid三氟乙酸A C NA eetonitrile乙睛N aA CSodium A cetate醋酸钠Surfaee Enhanced LaserD esorPtion Ionization表面加强激光SE LD I一TO F一M ST im e ofF lightM ass SPeetrom etry解吸电离飞行时间质谱M ALD IM atrix A ssisted LaserD esorPtion Ionization基质辅助激光解析电离M SM ass S Peetrom etry质谱M /ZM ass to E leetron质荷比SPA5inapinieA eid芥子酸TO FTim e ofFlight飞行时间W C XW eak C atio n Exehange弱阳离子交换ZD E2一D im ensionalPolyaerylam ide G el双向电泳EletroPhoresisR O CR eeeiverO Perating C haraeteristieC urve受试者工作特征曲线C H A PS3一[(3一CholanidoProPyl)dimethylammonio』小pro3一环乙胺一1一丙Panesulfonate磺酸C O NC ofltrol正常对照D T TD L一D ithioth reito l二硫苏糖醇M WM oleeu larW eight分子量M BM agnetic B e ad磁珠S/N5ignal/N oise信号噪声比HH ydroPhobie Surfaee疏水表面IM A CIm m obilized M etalA ffinityChrom atograPhy金属离子鳌合表面SA XStrong A nion Exeha nge强阴离子交换B M WB ioM arkerW izard软件名称了东华大学硕士论文英文缩写英文全称中文名称B PSB iom arkerPattern Softw are软件名称P B SP roteinC hiP B iom arkerSystem质谱仪名称C PCC iPhergen Prote inC hiP软件名称子东华大学硕士论文应用A U 和NP ZO芯片对大肠癌患者血清标志物的筛选比较研究及联合诊断模型的构建摘要大肠癌(ColorectalCancer，CRC)是最常见的消化道恶性肿瘤之一，发病率在全球人类高发肿瘤中位列第三，它包括结肠癌和直肠癌两部分，具有高死亡率，高复发率和高转移率的特点，且预后较差，所以对其的及时诊治就显得尤为重要。目前在临床上唯一被用来检测大肠癌表达产物的是血清CEA检测技术，然而一方面，大量的测试需要大量的血清CEA，这直接导致了测试价格的昂贵;另一方面，它存在假阳性率和假阴性率高的问题，特异性和敏感度均较低，故其在临床上的诊断价值有限。近年来，随着蛋白质组学技术的不断进步和发展，研究者以期通过此新技术找到更好的筛选和鉴定肿瘤的生物标志物，从而在肿瘤治疗中取得新突破。本研究分别从两种芯片出发，即金芯片(G。ld Chip)和正相亲水(NormalPhase 20，NPZO)芯片，采用分子流行病学(M。leeularEpidemiol。gy)的研究方法和理论，以中国人群为研究对象，创新性地结合磁珠与表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI一TOF一MS)技术检测大肠癌患者血清蛋白质组，包括筛选大肠癌血清候选标志物:不同临床分期大肠癌血清的差异表达蛋白筛选等;同时还探索性的研2东华大学硕士论文究了结肠癌和直肠癌之间的差异蛋白峰，试图以蛋白质组学的角度区分两者.最后，应用了决策树建模分析法建立了两种芯片的联合诊断模型，初步探讨了所建立的诊断模型在大肠癌早期诊断中的临床意义，以期优化实验结果.本文还比较分析了两芯片的实验结果并评价了本实验中运用的磁珠结合SELD工一TOF一MS技术，试图为筛选肿瘤标志物提供一个崭新的研究思路和技术平台.结果表明，癌症组与正常组样品间的差异非常显著，从NP20和Au两种芯片的分析结果来看，分别找到了m/z为13732.4和13912.3两种峰能较好的把两组样品区分开，而两个峰的位置相隔很近，推测这两种显著差异峰对应的化合物比较相似，说明两种芯片得到的结果较为吻合，它们有