应用基因表达谱芯片筛选盆腔器官脱垂相关基因的实验研究-临床医学专业论文.docx

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应用基因表达谱芯片筛选盆腔器官脱垂相关基因的实验研究-临床医学专业论文

英文缩略词表ABBREVIATIoN缩略词英文全称中文全称 POPPelvic Organ Prolapse盆腔器官脱垂 SⅥStress Urinary Incontinence压力性尿失禁PFDPelvic Floor Dysfunction盆底功能障碍性疾病A删Arcus Tendineus Levator碰肛提肌腱弓BMIBody Mass Index体重指数 HI盯Hormone Replacement Therapy激素替代治疗、ⅣHIWorld’S Health Initiative世界卫生协会SEI蝴Selective Estrogen Receptor选择性雌激素受体调Modulator节剂Pelvic Organ Prolapse盆腔器官脱垂定量分 POP-QQuantitation期法MMPMartrix Metalloproteinase基质金属蛋白酶ECMExtracellular Matrix细胞外基质TIMPTissue Inhibitor of‘组织金属蛋白酶抑制Metalloproteinase剂LOXLysyl Oxidases赖氨酰氧化酶EREstrogen Receptor雌激素受体bpBase pair碱基对DEPC Diethylpyrocarbonate 焦炭酸二乙酯 PBS Phosphate-buffered saline 磷酸盐缓冲液 RNase Ribonuclease 核糖核酸酶2摘要·研究目的: 1.应用基因表达谱芯片,筛选绝经后POP患者与正常绝经妇女主韧带组织中差异表达的基因 2.分析差异表达基因,探讨POP发生的分子机制·材料和方法: 1.在绝经状态、年龄、体重指数、产次等影响POP发生的重要因素匹配的前提下,选取3例POP与3例无POP对照的子宫主韧带组织标本。 2.组织标本行HE染色,Masson’s三色染色验证组织来源,并观察主韧带组织形态结构。 3.Trizol法提取总RNA,并对总RNA进行定量、质检。采用RNA扩增标记法合成生物素标记的eRNA,与Human Genome U133 Plus 2.0芯片杂交。4.用SAM软件筛选ISc幻re(d)I≥2,FC值大于2或小于O.5的差异表达基因。用MAS2.0软件对差异表达基因进行基因功能分类注释(GO)和代谢通路分析(Pathway)。5.实时荧光定量PCR验证DKKl,SFRPI,FZD5,WNTl6,COLlAl的差异表达。·实验结果:1.标本行HE染色、Masson’s三色染色观察,证实为子宫主韧带组织。POP组女 性子宫主韧带组织中胶原纤维与平滑肌束失去正常的排列,形态紊乱,可见胶 原纤维断裂,平滑肌束细碎。2.提取总RNA经定量和电泳检测,质量满足芯片杂交要求。杂交后芯片的各项检 测参数均达到质控要求,子宫主韧带组织与基因表达谱芯片的杂交模型建立成 功。3.筛选出179个在POP组和对照组之间差异表达的基因。其中包括20个功能未知 的基因。107个基因在POP组中表达上调,72个基因在POP组中表达下调。差 异基因涉及多种功能蛋白和代谢通路。其中Wnt信号转导通路变化最显著。4.实时荧光定量PCR证实DKKl,SFRPl,FZD5,WNTl6,COLlAl在POP组中表达明显升高,与芯片结果一致。●结论1.POP患者子宫主韧带组织中胶原纤维与平滑肌束细碎,排列紊乱。POP中编码I、III、V型胶原a1链蛋白的基因COLlAl、COL3A1、COL5AI的mRNA水平和MMP2的mRNA水平明显升高,提示POP中胶原合成增加,分解亦增强。 说明POP中胶原的合成和分解活跃,可能以分解为主,引起韧带支持结构功能 的改变,导致POP发病。2.人类全基因组表达谱芯片是一种有效的高通量筛选POP差异表达基因的研究方 法。本实验ISeore(d)lt2,FC≥2或FC≤0.5为标准筛选出179个在POP组和对照组之间差异表达的基因。其中包括20个功能未知的基因。107个基因在POP组中表达上调,72个基因在POP组中表达下调。 3.POP的病理生理过程复杂,涉及多种功能蛋白和代谢通路。其中Wnt信号转导通路的拮抗剂DKKl、SFRPl介导的神经退行性变可能与POP的发病密切相关。 4.实时定量荧光PCR验证目标基因DKKl,SFRPl,FZD5,WNTl6,COLlAl在POP组的表达明显高于对照组,变化趋势与芯片一致,佐证了芯片结果的可信性。【关键词】:盆腔器官脱垂(PoP);主韧带;基因表达谱芯片;Wnt信号转导通路;Diekkopf-1(DKKl):Secreted Frizzled Related Protein(SFRPl)4Microarray analysis of differential

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