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新的sca亚型候选基因的突变分析(三)-神经病学专业论文
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七年铡学位论文
七年铡学位论文 摘要
摘要
背景
遗传|生脊髓小脑性共济失调(Spinocerebellar ataxia,SCA)是~类具有高 度临床和遗传异质性的神经系统退行性疾病,因病变多累及小脑及其联络 纤维、脊髓和脑干而得名。多于中青年起病(一般30岁左右),临床上以 慢性进行性小脑性共济失调为主要表现,可伴有其他神经功能异常,如: 构音障碍、意向性震颤、眼肌麻痹、锥体束征和(或)锥体外系表现等,许多
患者迸有其他系统异常表现,如视网膜色素变性、听力障碍、内分泌异常 等。其病理改变主要表现为小脑、脑干和脊髓神经细胞变|生脱失和胶质增 生。SCA多数呈常染色体显性遗传,少数为散发病例。到目前为止,呈常 染色体显性遗传的己发现至少28种基因型,其中王8种亚型的致病基因已 被克隆,包括SCAl、S例2、MJDl、PLEKHG4、SPTBN2、CACNAlA、 sCA7、sCA8、sCAlO、ffBK2、PPP2R2B、KCNC3、pRKCG、ITPRl、
CNTN4、TBP、FGFl4及DRPLA基因。在前期工作中,我们对一个来自 中国湖南望城的SCA家系患者进行突变检测排除了SCAl、SCA2、 SCA3瓜酊D、S(¨滔、SCAT、SCA8、SCAIO、SCAl2、SCAl7、SCA27、
DRPLA基因型;经连锁分析排除其它已知的SCA亚型:SCA4、SCA5、 SCAll、SCAl3、SCAl4、SCAl5、SCAl6、SCAl8、SCAl9、SCA20、 SCA2l、SCA22、SG地3、SCA25、SCA26、SCA28;通过全基因组扫描
结合单体型分析,在D16S415褥到最大两点LOD值2。79,并将该SCA家
七年制学位论文
七年制学位论文 摘要
系的致病基因定位于D16S3136与D16S3057之间15cM的区间,位于 16q12.1-q13,这是一新的SCA亚型致病基因位点,暂命名为SCA31。
蠹的 克隆该新的遗传性脊髓小脑性共济失调亚型的致病基因。 方法
采用“位置候选克隆”策略,应用生物信息学等方法,筛选lO个候 选基因;设计合成扩增候选基因外显子及其与内含子交界的引物,用 DNA直接测序法对PCR产物测序然后进行序列变异分析。
继霉
拳辩刁阵
应用生物信息学方法筛出1 O个候选基因,分别为NUP93、IRX3、 ZNF423、RSPRYl、ARL2BP、MMP2、CY乙D、CESl、h重liiB、M72A 基因。应用DNA直接测序方法,未发现致病突变。在NUP93、ARL2BP 和MT2A基因未发现任何序列变异。在IRX3、ZNF423、RSPRYl、MMP2、 CIZD、CESl、MTIB基因共发现20个序列变异,如:IRX3基因的
.235CA、.3 1CG、IVSl-46TC;ZNF423基因的IVS8-23 GA;鑫撩护2
基因的ⅣS2+185@峻、750CT、l 149TC、IVS8+85GC、IVS9+92GA、
ⅣS9.66TG、ⅣS11qG、峻、ⅣS1 1-69CT;CYLD基因的IVS 16+26AG、
*456IGA;嬲翳基因的IVSl0+36TC;CESl基因的IVS9.5TG;
MTIB基因的ⅣS1.109GC、IVSl.112TA、IVSl.12GT、ⅣS2+156GA。
均已被NCBI的dbSNP数据库报道。
II
七年制学位论文
七年制学位论文 摘瑟
结论
1.排除了NUP93、1RX3、ZNF423、RSPRYI、ARL2BP、MMP2、
CYLD、CESl、MTIB、MT2A基因为此新的SCA亚型致病基因的可能; 2.发现IRX3基因的.235CA、.3 1D好、IVSI-96TC;ZNF423基
因的ⅣS8乏3GA;MMP2基因的ⅣS185GA、750C,T、1149DC、 ⅣS8+85GC、ⅣS争均2GA、ⅣS9-661G、ⅣS 1 1-4GA、IVS 1 1-69CT; CY/Z)基因的IVSl6+26AG、*4561GA;RSPRYl基因的IVSl0+36TC;
CESl基因的IVS9.5TG;MTIB基因的IVSl.109GC、IVSl.112TA、 IVSl.12GT、IVS2+156GA等20个序列变异,均是NCBI的dbSNP 数据库已报道的序列变异。
关键词脊髓小脑性共济失调,生物信息学方法,候选基因,突变 分析,DNA直接测序
III
七年制学位论文
七年制学位论文 Abstract
ABSTRA
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