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应用SSAP技术分析渐渗系后代多样性研究_毕业论文 陈志青
本科生毕业设计(论文)
中文题目 应用SSAP技术分析渐渗系后代多样性研究
外文题目 SSAP technique analysis of diversity
in offspring introgression lines
学 号 0907040010
姓 名 陈志青
学 院 生命科学学院
专 业 生物科学（师范类）
指导教师 罗向东
完成时间 2013年4月18日
江西师范大学教务处制
目录
目录 I
摘 要 2
Abstract 3
引 言 4
1 文献综述 5
1.1 植物渐渗杂交的研究进展 5
1.1.1渐渗杂交概述 5
1.1.2 渐渗杂交可激活沉默的转座元件 5
1.2 植物逆转座子的研究进展 5
1.2.1 逆转座子的类型与结构 6
1.2.2 逆转座子的转座活性 7
1.2.3 逆转座子的转座机制 7
1.3基于逆转座子的SSAP分子标记 7
1.4 SSAP分子标记的应用 8
1.5本课题的立项依据和研究意义 9
2 材料与方法 9
2.1供试材料 10
2.2 实验方法 10
2.2.1 模板DNA的制备 10
2.2.2 基因组DNA酶切 11
2.2.3连接接头 11
2.2.4 预扩增 12
2.2.5 选择性扩增 12
2.2.6 扩增产物的检测 14
2.2.6.1 变性聚丙烯酞胺胶电泳 14
2.2.6.2 SSAP条带的显色 14
2.3 数据统计 15
3 结果与分析 15
3.1 遗传多样性分析 15
3.2 群体PCA分析 16
3.3 系统进化树分析 16
4 讨 论 17
参考文献 19
附录A 21
A.1 主要实验仪器 21
A.2主要试剂 21
符号表 22
致谢
摘 要
逆转座子的高拷贝数特点和稳定的遗传特性使其在分子标记领域有着巨大的应用潜力,高等植物中的逆转座子主要属于Ty1-copia类,基于其LTRs的SSAP已成为最有用的分子标记技术之一。
本研究利用本实验室分离到的东乡野生稻渐渗系后代Ty1-copia类逆转座子的LTRs,建立了研究东乡野生稻渐渗系后代多样性的SSAP技术。对46个材料包括东乡野生稻渐渗系、中国栽培稻以及国外栽培稻进行遗传多样性分析。SSAP序列特异性引物根据Ty1-copia类逆转座子houba、osr15和osr17的LTR区域设计。结果扩增得到140条条带，进一步分析可以将这些条带分为6个家族,东乡野生稻后代几乎分布于每个家族中; PCA分析也发现, 东乡野生稻渐渗系后代分布广泛。渐渗系后代的平均Neis基因多样性He）结果为
关键词：渐渗系，栽培稻，SSAP，多样性
SSAP technique analysis of diversity in offspring introgression
Chen Zhiqing
Directed by Professor Luo Xiangdong
Abstract
The stable of genetic characteristics and high copy number of retrotransposons made it has great potential applications in the field of molecular markers, retrotransposons in higher plants are mainly belongs to the Ty1-copia class, The SSAP based on LTRs has become one of the most useful molecular marker technology.
This study use the LTRs of offspring introgression lines derived from Dongxiang wild rice , it is the class of T
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