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江西省猪群感染戊型肝炎病毒的检测及序列分析.ppt

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江西省猪群感染戊型肝炎病毒的检测及序列分析

* 博士生:何后军 导师:陆承平教授 江西省猪群感染戊型肝炎病毒的检测及序列分析 南京农业大学动物医学院、江西农业大学动物科技学院 电话:0791-3813149 E-mail: hehoujun@ 1、江西省科技厅重点课题 戊型肝炎病毒在我省猪群中感染状况的研究 2、江西省农业厅重点课题 江西省的猪群感染戊型肝炎病毒的研究 课题来源 选题背景 A猪场:30份样本中有7份为阳性,阳性率23.33%(7/30) B猪场:43份样本中有11份为阳性,阳性率25.58%(11/43) C猪场:18份样本中有4份为阳性,阳性率22.22%(4/18) D猪场:49份样本中有7份为阳性,阳性率14.29%(7/49) E猪场:51份样本中有4份为阳性,阳性率7.84%(4/51) 结果 平均阳性率为17.28%(33/191) 0~1月龄:样本31份有3份为阳性,阳性率9.68%(3/31) 1~2月龄:样本24份有7份为阳性,阳性率29.17%(7/24) 2~3月龄:样本36份有10份为阳性,阳性率27.78%(10/36) 3~4月龄:样本17份有3份为阳性,阳性率17.65%(3/17) 4~5月龄:样本25份有3份为阳性,阳性率12.00%(3/25) 5~6月龄:样本26份有4份为阳性,阳性率15.38%(4/26) 大于6月龄:样本32份有3份为阳性,阳性率9.38%(3/32) 结果 试验还对猪群HEV与PCV-2共感染进行了检测。 对90份疑似感染猪血清进行PCV-2检测,结果有58份为阳性,阳性率64.44%(58/90)。 对58份PCV-2阳性血清同步进行HEV RNA的检测,有6份为阳性,猪群HEV与PCV-2共感染率为10.34%(6/58)。 结果 在33份HEV RNA阳性样本中,随机选取其中7份的PCR扩增产物和6份HEV与PCV-2共感染率HEV RNA的PCR扩增产物纯化并测序。13个分离株ORF2 236bp同源性为80.4%~100%,为同一基因型,与HEVⅠ、HEV Ⅱ、HEV Ⅲ型的同源性分别为68.5%~76.4%、70.6%~82.3.%和74.5%~83.7%,与HEV Ⅳ型的同源性76.9%~90.8%。对以该236bp片段绘制的进化树进行分析,13个分离株与Ⅳ型的代表株T1在同一分支上,属基因Ⅳ型。 结果 *

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