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8章-RNA的生物合成.ppt
第八章 RNA的生物合成 RNA的生物合成包括转录和RNA的复制。 转录(transcription):以一段DNA的遗传信息为模板,在RNA聚合酶作用下,合成出对应的RNA的过程(DNA指导的RNA合成)。 转录产物:mRNA 、rRNA、 tRNA、小RNA 除某些病毒基因组RNA外,绝大多数RNA分子都来自DNA转录的产物。 转录研究的主要问题 ①RNA聚合酶 ②转录过程 ③转录后加工 ④转录的调控 ①~③是基本内容,④是目前研究的焦点,转录是基因表达的第一步,也是最关键的一步。转录水平的调控是基因调控的核心。 基因表达的终产物:①RNA ②蛋白质 第一节?? 转录 一、RNA聚合酶催化的转录过程(E.coli) 王镜岩P457 图36-2 1、?? 起始 RNA聚合酶结合到DNA双链的特定部位(启动子区即RNA聚合酶识别结合和开始转录的基因中的一段DNA序列),局部解开双螺旋,第一个核苷酸掺入转录起始位点,从此开始RNA链的延伸。 在新合成的RNA链的5’末端,通常为pppG或pppA,即合成的第一个底物是GTP或ATP。因此RNA合成方向是5‘-3’。 起始过程中,σ因子起关键作用,它能使聚合酶迅速地与DNA的启动子结合,σ亚基与β’结合时,β’亚基的构象有利于核心酶与启动子紧密结合。还常需要一些起始因子参与。 正链(有意义链):又叫编码链,5‘-3’。与mRNA序列相同的DNA链。 负链(反意义链):模板链,3‘-5’。 转录起点是+1,上游是-1。 转录的起点核苷酸为+1,起点右边为下游(转录区),用正数表示,起点左侧为上游,用负数表示:-1,-2,-3。 2、?? 延长 转录起始后,σ亚基释放,离开核心酶,使核心酶的β’亚基构象变化,与DNA模板亲和力下降,在DNA上移动速度加快,使RNA链不断延长。 转录起始后,σ亚基便从全酶中解离出来,然后nusA亚基结合到核心酶上,由nusA亚基识别序列。常需要转录因子( DNA转录中协助转录的辅助因子)参与。 3、?? 终止 RNA聚合酶到达转录终止点(终止子区即基因中提供转录终子信号的DNA序列)时,在终止因子(DNA转录中协助RNA聚合酶识别终止信号的辅助因子)的帮助下,聚合反应停止,RNA链和聚合酶脱离DNA模板链,nusA又被σ亚基所取代。 由此形成RNA聚合酶起始复合物与终止复合物两种形式的循环。 ★转录与DNA复制的异同: 相同:要有模板,新链延伸方向5’→3’,碱基的加入严格遵循碱基配对原则。 相异:①复制需要引物,转录不需引物。 ②转录时,模板DNA的信息全保留,复制时模板信息是半保留。 ③转录时,RNA聚合酶只有5’→3’聚合作用,无5’→3’及3’→5’外切活性。 二、? RNA聚合酶 1、?? E.coli RNA聚合酶(原核) E.coli和其它原核细胞只有一种RNA聚合酶,合成各种RNA(mRNA、tRNA、rRNA)。 E.coli RNA聚合酶全酶(holoenzyme)分子量46万Da,由六个亚基组成,α2ββ’ σω,另有两个Zn2+。 不同的细菌,β’、β、α亚基分子量变化不大,σ亚基分子量变化较大,44KD~92KD。 σ亚基的功能:无σ亚基的酶叫核心酶,核心酶只能使已开始合成的RNA链延长,而不具备起始合成活性,加入σ亚基后,全酶才具有起始合成RNA的能力,因此,σ亚基称为起始因子。 核心酶在DNA上滑动,σ亚基能增加酶与DNA启动子的结合常数,增加停留时间,使聚合酶迅速找到启动子并与之结合,σ亚基本身无催化活性。 不同的σ因子识别不同的启动子,从而表达不同的基因。 不同的原核生物,都具有相同的核心酶,但σ亚基有所差别,这决定了原核基因表达的选择性。 E.coli RNA聚合酶各亚基的大小与功能: ?一个E.coli细胞中约有7000个RNA聚合酶分子,在任一时刻,大部分聚合酶(5000左右)正在参与RNA的合成,具体数量依生长条件而定。 ★RNA聚合酶的催化活性:RNA聚合酶以完整的双链DNA为模板,转录时DNA的双链结构部分解开,转录后DNA仍然保持双链的结构。 ?王镜岩P456 图36-1RNA聚合酶的活性中心,p584图20-5 纯的RNA聚合酶,在离体条件下可转录双链DNA,但在体内,DNA的两条链中只有一条可用于转录,这可能是由于RNA聚合酶在分离时丢失了σ亚基引起的。 解旋和重新螺旋化也是RNA聚合酶的内在特性,在酶的前端解螺旋,在后端以相反方向重新螺旋化,活体状况中,可能还有其它酶活性来帮助调整DNA的拓扑学性质。 37℃时,RNA聚合酶的聚合速度可达40~100个核苷酸/秒 2、?? 真核生物RNA聚合酶 三种细胞核内的RNA聚合酶:RNA聚合酶
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