第二章(6)化学专业型数据库.ppt

5．2剑桥结构数据库(CSD) 剑桥结构数据库(cambridge structural Database，CSD，)是剑桥晶体结构数据中心建立的有机小分子和金属结构的数据库。 是全球最大的晶体结构的数字化数据库，库中数据均经过了x射线或中子衍射实验的分析。 CSD是同类科学数据库中应用最广泛和最负盛*名的一个。 CSD提供的结构数据是收费服务，如需要可直接与之联系 5.3化合物基本性质数据库(CS ChemFinder) CS ChemFinder是CambridgeSoft公司在推出的化学数据库检索服务。 ChemFinder可通过化合物名称、相对分子质量、CAS登录号和化学结构等进行查询。 可以得到该化合物的基本性质，包括分子结构、相对分子质量、熔点、沸点、密度、水中溶解度等及该化合物的生产厂家、包装说明及购买方法 。 以马钱子碱(strychnine)为例检索CS ChemFinder， 5．4布鲁克海文Brookhaven蛋白质数据库 蛋白质数据库PDB(protein data bank)是生物大分子的三维结构数据库。 它包括了原子坐标、文献出处、一级序列及二级结构信息、晶体结构因子及2D-NMR实验数据等。 所涉及的大分子包括蛋白质、DNA、RNA、病毒和碳水化合物等。 5.5 Chemistry WebBook 物性数据库 Chemistry WebBook是美国国家标准与技术研究院NIST(National Institute of Standards and Technology)开发的基于Web的物质数据库，它被认为是INTERNET上著名的免费化学数据库之一。 Chemistry WebBook可以看作是NIST标准数据库中与化学有关的数据库 NIST Chemistry WebBook提供的主要参考数据有以下几类： （1）7000多个有机和小的无机化合物的热化学数据，包括生成焓、燃烧焓、热容、熵、相变焓、相变温度、蒸气压等。 （2）8000多个反应的反应热力学数据，包括反应焓和反应自由能。 （3）16000多个化合物的IR谱。 （4）15000多个化合物的质谱数据。 （5）1000多个化合物的UV-Vis光谱数据。 （6）4500多个化合物的电子和振动光谱数据。 （7）600多个化合物光谱数据的双原子分子常数。 （8）16000多个化合物的离子能量数据，包括电离能、表面能、电子亲和能、质子亲和能、气体碱性和离子簇结合能。 （9）34种流体的热物理数据，包括密度、恒压热容、恒容热容、焓、内能、熵和声速等。 多种检索途径，有分子式、物质名称、CAS登录号、作者名、结构或子结构检索等。 5．6中国科学院科学数据库 中国科学院上海有机化学研究所（）的数据库群是服务于化学化工研究和开发的综合性信息系统，可以提供化合物有关的命名、结构、基本性质、毒性、谱学、鉴定方法、化学反应、医药农药应用、天然产物、相关文献和市场供应等信息。 注册后即可免费使用数据库 （1）化合物结构数据库 收录了1,200,000多个化合物，多库融合检索平台将多个不同类型，不同结构，不同软件支持的本地及异地数据库置于一个统一检索平台，使用户可以同时从各个不同数据库检索信息，也可以只选择一个数据库进行检索。 通过全结构检索，子结构检索以及模糊结构检索可查出目标化合物的物化性质，二维、三维结构，红外光谱图，质谱谱图，相关参考文献等。 （2）化学反应数据库 覆盖了国内外化学文献中报道的大量化学反应 检索途径为化学反应物检索，反应产物检索，反应溶剂、催化剂检索及组合检索等 可获取相关反应信息及参考文献等，对反应机理研究，合成路线设计具有相当参考意义。 （3）红外谱图数据库 收录了大约220,000多个化合物 通过特定格式转化的红外光谱文件以峰位检索，强峰检索，功能团检索以及组合检索，也可以通过化合物名称，化合物分子式检索，获取需要的化合物 主要包括其红外光谱图，物化性质以及CA登录号等信息。 （4）质谱谱图数据库 收录了大约12,000多个化合物 检索途径为质荷比检索，丰度检索以及组合检索 可获取化合物质谱谱图，物化性质等信息。 （5）药物与天然产物数据库 覆盖来自不同数据库的药物和天然产物信息资源，其中药物信息1万多条，主要是关于药物的物化性质、相关专利以及参考文献 另包括13万多个天然产物信息。 （6）中药与有效成分数据库 将数千年来中国传统中医的临床实践融合成一个内涵丰富疾病用药—中药药材—化合物性质的多层次信息数据库 包括50,000余个处方，1,400多种疾病用药。 （7）化学核心期刊数据库 收录了1990年—1999年国外化学期刊文献共1,208,800篇，检索途径为关键字检索，作者名检索，期