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大规模基因表达谱数据分析方法芯片分析能够检测不同条件下的基因转录变化,能够显示反映特征组织类型、发育阶段、环境条件应答、遗传改变的基因谱。当芯片数据大量出现,产生了新的问题:如果将所有获得的数据集中起来,我们能否将未知功能的新基因归类到已知功能分类中?能否将基因表达与基因功能联系起来?能否发现新类型的共调控基因?能否从芯片表达数据中得出完整的基因调控网络?这些唯有通过计算的方法。基因制图及测序所面临的问题与大规模基因表达分析的数学问题相比要小的多。这种新类型的表达数据使我们直接面对生物系统和基因组水平功能的复杂性,从生物系统单个成分的定性发展到完整生物系统行为的描述上来,这方面困难很多,目前只
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