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WRKY35转录因子cDNA克隆与植物表达载体构建
WRKY35转录因子的cDNA克隆与植物表达载体的构建
摘要:文章以丁香假单孢菌处理的哥伦比亚型拟南芥为植物材料,利用RT-PCR 技术获得了拟南芥WRKY35转录因子的cDNA编码序列。序列分析表明,WRKY35核苷酸序列长1363bp,CDS全长1314bp,编码438个氨基酸,含有一个典型的WRKY结构域,具有WRKY 转录因子的典型特征。将该基因的cDNA编码序列连接到植物表达载体pBI121中,成功构建了拟南芥的WRKY35基因的植物表达载体,为进一步通过转基因技术研究该基因的功能奠定了基础。
关键词:拟南芥;WRKY;转录因子;基因克隆;植物表达载体
中图分类号:Q78 文献标识码:A 文章编号:1674-0432(2010)-09-0039-2
0 前言
植物转录因子的研究已经成为现今植物基因功能研究的一个重点。植物基因组中有相当的一部分基因是以家族形式出现,并参与因外界环境变化所导致的植物体内分子信号传递, 或诱导基因转录调控??程。在研究众多的转录因子中,WRKY转录因子是近年来研究较为广泛的植物特有的转录因子。该家族的cDNA最初从甜马铃薯、野燕麦、欧芹和拟南芥中克隆获得。这类转录因子名称来源于其蛋白含有高度保守的60 个氨基酸组成的WRKY结构域。WRKY蛋白可与含有(T)TGACC(A/T)(W盒,W-box)核心序列的DNA特异结合,并被证明能与自身启动子中的W盒结合来参与表达调控。在拟南芥中,WRKY家族共有74个成员,主要与植物的抗逆性和衰老等生理过程有关。水稻中有100余个成员,主要分布在1号和5号染色体上。病原菌、伤害和植物激素类物质等多种外界因素均能诱导WRKY基因的表达。WRKY类转录因子被证实除参与植物的抗病反应外,还影响植物的衰老、抗胁迫能力以及生长和发育。
本研究以丁香假单孢菌处理的拟南芥为植物材料,通过RT-PCR 技术,获得了拟南芥的WRKY35 基因cDNA序列,对其进行测序和分析,并将此基因构建到植物表达载体pBI121上,为提高植物的抗病性奠定了基础。
1 材料和方法
1. 1 试验材料
1.1.1 材料 本试验所用植物材料为哥伦比亚型拟南芥,由本实验室保存。基因克隆所用大肠杆菌(E.coli)菌株为DH5α,由本实验室保存。克隆载体pEASY-T1、植物稳定表达载体pBI121由四川大学惠赠。
1.1.2 主要试剂 Taq DNA聚合酶、限制性内切酶、T4 DNA Ligase、AMV反转录试剂盒、等均购自TaKaRa公司。Trizol RNA提取液、U2NIQ210 柱式质粒抽提试剂盒等购自上海生工生物工程公司。
1.2 试验方法
1.2.1 材料处理 将拟南芥的种子进行表面消毒后,播种于MS固体培养基上,待长出2-3片真叶时,用0.5mM的水杨酸处理1h后取整个植株提RNA,-70℃保存备用。
1.2.2 引物的设计与合成
根据网址www.省略公布的WRKY35基因的cDNA序列设计合适的引物WRKY35(1-1)sense、WRKY35(1-1)antisense,目的基因扩增出来后连接到克隆载体pEASY-T1上,然后在上下游引物分别添加Xba I和SacI酶切位点WRKY35(2-1)sense、WRKY35(2-1)antisense,引物由上海华大基因有限公司合成,序列如下:
WRKY35(1-1)sense:5-3:ATGGACAACTTCCAAGGA
WRKY35(1-1)antisense:5-3CAAAGGCAAATACCGTCA
WRKY35(2-1)sense:5-3:GCTCTAGAGCATGGACAACTTCCAAGGA
WRKY35(2-1)Antisense:5-3 CCGAGCTCGGCAAAGGCAAATACCGTCA
1.2.3 目的基因的扩增与克隆 以反转录产物cDNA为模板,WRKY35(1-1) sense和WRKY35(1-1) Antisense为引物,进行PCR扩增。PCR反应按以下体系进行,PCR反应条件为:94℃预变性3min;94℃变性30s,60℃退火40s,72℃延伸120s,32个循环;72℃后延伸10min。PCR产物经琼脂糖电泳分离后回收纯化,回收片段连接到pEASY-T1,并转化到感受态大肠杆菌DH5α中,在含有50μg/mL氨苄青霉素的LB平板上进行筛选,PCR鉴定出的阳性克隆送上海华大基因有限公司进行测序。
1.2.4 序列分析 相似性比较及开放阅读框(ORF)分析用生物分析软件DNA MAN完成。
1.2.5 植物表达载体的构建 采用UNIQ210柱式质粒抽提试剂
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