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求解蛋白质折叠问题的拟人算法对PERM 的改进
49 17 2004 9
: PERM
*
(, 430074. * , E-mail: lzup_cn@sina .com)
PERM(Pruned-Enriched-Rosenbluth Method)
. PERM , ,
. PERM
. : 4
, PERM . 4 3 ,
.
PERM
. NP . ,
, , :
. , SISPER [4](Sequential Importance
. Sampling with Pilot- Exploration ); Monte Carlo
MSOE [5](Multi-Self-Overlap Ensemble)
. PERM[6~8] (Pruned-Enriched-Rosenbluth Method).
, ,
. , , .
,
1 PERM
,
. [1,2]HP (HP Lattice 1.1
Model), . PERM (Growth Algorithm).
[3] 2 ,
α - .
, (Hydrophobic, , N ().
H )(Polar, P ). 1 : n (2 n N − 1)
H, P , PHHPPPHHHPHH( . n + 1
, H , P ). n 1
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