化学信息学 Cheminformatic Tools for Medicinal Chemists.pptVIP

Cheminformatic Tools for Medicinal Chemists ——Less experiments,better results, is that true? Cheminformatics 化学信息学是近年来出现的将化学和信息科学融合成为必威体育精装版研究前沿的交叉学科, 涵盖了理论计算、新算法发展、新知识和新化学实体的发现以及化学虚拟现实等领域。可以广义的被定义为利用化学信息揭示化学性质与结构之间的关系，从药物发现的角度，化学信息学的一些准则可以应用在早期的研究步骤（例如构效关系的研究与毒性的预测） Cheminformatics Tools 化学信息学工具通过数据挖掘和分析，以及结构表征和优化，帮助研究者在现代研究方法中（如组合化学与HTS）提取大量有用信息，促进药物研发进程。 —— Cheminformatic Journals The Journal of Cheminformatics The Journal of Computer-Aided Molecular Design Molecular Bioinformatics QSAR and Combinatorial Science The Journal of Chemical Information and Modeling 已有15000篇化学信息学的研究论文在最近五年发表 雅培科学家常用的化学信息学工具模块 Pipeline Pilot 理化性质与配体效率 Property Calculation page 理化性质 Leadhopper2D/3D 相似检索 RocsOverlay 3D 分子叠合 DrugGuru 寻找生物电子等排 RcosDock 基于分子结构的3D对 PyMol 作图使分子可视化 Accelrys Accelrys是一流的药物研发解决方案提供者，为药物化学家提供强大的研究工具。涵盖了基因组学、蛋白质组学研究到药物靶点确认和结构解析，基于靶点的先导化合物发现，基于活性化合物结构的先导化合物优化，先导物ADME/T性质预测等领域。能够帮助科学家显著提高的效率。 Pipeline Pilot Accelrys的Pipeline Pilot是业界领先的基于流程化（Protocals）的计算模拟及信息管理平台，已在国际上众多学术机构及超过300家的企业得到了广泛应用。它集成了大量的功能组件，能够实现工作流程的构建和共享，完成复杂应用环境下的高效率资源整合，用于计算分子的大部分理化性质与配体效率。 Pipeline Pilot不仅能让研究人员用更方便和更有效的方式来整合并应用那些复杂难学的计算模拟和信息管理工具，而且能让实验科学家用更简洁和更友好的方式了解、掌握并应用理论与模拟计算的必威体育精装版成果 。 Property Calculation page 这是一类网络工具，用于计算理化性质，并有着子结构检索与类比功能。 Data for General, Organic, and Physical Chemistry / i.F M College; ii.Colby College Data Search for Species by Chemical Formula / NIST Dielectric Constants / ASI Instruments Inc. Chemical and Physical Properties Webliography / LSU Properties of 200 linear macromolecules and small molecules / ATHAS LeadHopper combines 2D (ECFP6) and 3D(ROCS) methods for compound similarity searches。 基于形状相似性的虚拟筛选工具 RocsOverlayRocsDock ROCS is a powerful virtual screening tool which can rapidly identify potentially active compounds with a similar shape to a known lead compound. （ROCS是一款基于结构相似性的虚拟筛选工具） ROCS is a fast shape comparison application，It uses a Gaussian function to represent the molecular volume （利用高斯函数计算呈现