EP1高通量基因分析系统简介.docVIP

EP1高通量基因分析系统  EP1?高通量基因分析系统是集成流体通路（Integrated Fluidic Circuit，IFC）技术、终点PCR技术及强大的基因分析软件相结合的技术平台。其创新技术就在于集成液体通路技术：利用集成电路制作工艺（光刻）在硅片或石英玻璃上刻上许多微管和微腔体，通过不同的控制阀门控制溶液在其中的流动来实现生物样品的分液、混合、PCR扩增。集成流体通路技术极大地简化了生物样品和试剂的分液操作，提高分析通量和灵敏度，其纳升级的反应体系为高通量的基因分析应用节省大量成本（试剂用量更少，样品量更少）。EP1?高通量基因分析系统由EP1? Reader，PCR仪、IFC微液流芯片（耗材）、IFC Controller（将生物样品、反应试剂导入到IFC微液流芯片中）和基因分析软件四部分构成。IFC微液流芯片有2种：Dynamic Array（48.48动态芯片和96.96动态芯片）和Digital Array（12.765数码芯片和48.770数码芯片），应用于不同的基因分析中：拷贝数变化分析、遗传突变检测、基因分型等。 从下面的具体应用及跟传统基因分析方法的比较上，我们可以很直观地看到EP1?高通量基因分析系统在通量、灵敏度、灵活度上的革命性的突破。 1.EP1? Digital Array数码芯片 : 样本与试剂只需纳升级 (nl) 比传统方法少1,000倍, 大幅减少试剂用量 通过IFC部件, 样本浓缩1000倍, 敏感度大大提高，检测更准确，能检测到单拷贝, 高重复性 使用传统试剂, 操作简单快捷, 省去再开发时间 应用广泛, 如样本定量 (Slingshot), CNV, Haplotype, 遗传病/突变检测等 （1）Slingshot系统?:?第二代测序仪样本浓度确定——无需参照样本, 绝对定量, 高效替Roche GS 454、ABI SOLiD和Illumina Solexa等第二代测序平台上机前作样品浓度准确定量，可大大减少试剂用量！（2）拷贝数变化?/?遗传病?/?突变检测 拷贝数变化（Copy Number Variation, CNV）广泛用于药物代谢、癌症、免疫相关疾病、人类基因组变异以及由基因变异引起的相关疾病的研究。?EP1TM?Digital Array 采用 12x765阵列PCR反应芯片，通过数字PCR，每个反应体系用量仅6 nL, 可有效分辨12与13倍（或更高）的差异。 采用常规PCR?方法和试剂, 无需改变工作流程, 结果一目了然, 方便比较 最多能兼容4种荧光染料， 进行多通道PCR ??而传统分析方法?：?SNP微阵列分析或比较性基因组杂交(CGH) 敏感性和分辨率较低，缺乏客观标准，不能准确量化结果 操作烦琐, 需要大量本试剂， 假阳性非常高 常规qPCR技术: 最多只能分辨2与3倍的DNA拷贝数差异， 试剂价钱昂贵。2.Dynamic Array 动态芯片： 高通量，最高每次可处理9216个qPCR反应（96样本× 96基因） 采用常规试剂方法, 用量为传统1% （反应为nl级） 无需繁琐加样, IFC全自动进样混合,减少人为误差 利用IFC技术自动操作，重复性好 样品、反应液组合自由多样，应用广泛，用户弹性大 ??基因分型 ——通过简单加样，EP1? 基因分析系统能在短时间内分析成千上万个基因 （96×96 / 48×48）： 更少试剂用量、更低成本 所以常规方法但更高通量 更高检出率（Call Rate），99.5% 更快更高效，可日处理7万个基因型对2000个样品进行基因分型时，使用384微孔板与48.48 Dynamic Array的对比结果： ?384微孔板48.48动态阵列总运行次数25042同时运行反应数3842,304总移液次数192,0004,032总反应体积480 ml5.1 ml?综合评定EP1?高通量基因分析系统， ·??IFC整合系统，简化传统PCR操作步骤，使操作流程简化至1/48（48.48动态芯片）或1/96（96.96动态芯片）。?·??基因分型结果与ABI 7900 荧光定量数据具有很好的一致性。?·??重复性好，批内批间相关系数极高，p=00.0000。?·??高通量，Dynamic Array最多可实现9216个样本的同时检测，Digital Array一张芯片上最多可同时进行10,000(12.765数码芯片)或37,000（48.770数码芯片）个反应。?·??nl级反应体系，比传统试剂耗费减少100倍，成本消耗节省一倍以上。·??人性化数据分析软件，使您更加灵活的得到可靠数据。 在实际的科研应用中，越来越多的报