ⅲ型钠通道scn3a基因启动子区cfos转录调控元件的功能研究-study on the function of cfos transcription regulatory element in scn3a promoter region of type ⅲ sodium channel.docx
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ⅲ型钠通道scn3a基因启动子区cfos转录调控元件的功能研究-study on the function of cfos transcription regulatory element in scn3a promoter region of type ⅲ sodium channel
征并预测与之相关的调控元件,选择预测的 c-Fos 调控元件进行功能研究。采用定点诱变的方法对 c-Fos 调控元件位点进行缺失突变,构建缺失突变后荧光素酶报告基因 表达载体(PGL4-F1.1-cFos-del),分别转染 PC12 细胞和 NGF 诱导的 PC12 细胞后, 根据双荧光报告系统测定的相对荧光素值,统计分析调控元件的功能。为研究转录 因子与调控元件的结合,构建转录因子的表达质粒,并在编码转录因子序列前端插 入编码 V5 标签蛋白的序列,采取 Western Blot 实验证明融合蛋白的表达。合成生物 素标记的带有调控元件的 DNA 探针,采取凝胶阻滞的电泳迁移实验,分析探针与蛋 白的结合情况。结果:1. hSCN3A 基因最小功能启动子及其上游转录调控区的鉴定对 hSCN3A 基因启动子不同长度片段(F0.9、F0.7、F0.5、F0.3、F0.2、F0.1)的 分析表明,F0.9 和 F0.7 与 F1.1 比较,相对荧光素酶活性分别下降约 30%和 80%,这 两个区域为正性调控区域,该区域可能存在正性调控元件;在转录起始点上游 -548 到+ 174 bp 区活性改变不明显, 为最小功能启动子。2. hSCN3A 基因启动子区潜在的转录调控元件使用软件预测 hSCN3A 基因启动子转录起始点上游的正性调控区域内的转录 调控元件,发现了多个潜在的转录调控元件,同时我们选取预测的 c-Fos 转录调控元 件进行后续的功能研究。3. hSCN3A 基因启动子区 c-Fos 转录调控元件上调报告基因表达,且需要 NGF参与通过对 c-Fos 转录调控元件敲除质粒的活性分析,在 PC12 细胞中,野生型质粒 的活性与 NGF 诱导的 PC12 细胞相比较下降 40%,而 c-Fos del 质粒无差异;在 NGF 诱导的 PC12 细胞中,c-Fos del 质粒的活性与野生型质粒相比较下降 50%,而在 PC12 细胞中 c-Fos del 质粒与野生型质粒活性无差异。结果表明,在 PC12 细胞中,只有 在 NGF 诱导条件下,c-Fos 元件才能显著性上调 hSCN3A 基因启动子活性。4. NGF 上调 PC12 细胞内源 Scn3a 基因表达的影响使用 RT-PCR 和荧光定量 PCR 的方法对 PC12 细胞的内源 Scn3a 基因表达进行 分析,RT-PCR 结果显示,在 NGF 诱导情况下,PC12 细胞的内源 Scn3a 基因 PCR的条带浓度明显较无 NGF 时高,同时荧光定量 PCR 显示,在 NGF 诱导情况下,PC12细胞的内源 Scn3a 的转录本明显较无 NGF 时高,上述结果表明 NGF 能上调 PC12 细 胞内源性 Scn3a 基因表达。5. c-Fos 蛋白与转录调控元件不直接结合为研究 c-Fos 与调控元件是否直接结合,本研究首先构建 V5-c-Fos 融合表达载 体,并采用 Western Blot 实验证明异源表达的融合蛋白 V5-c-Fos 是否被运至细胞核。 采取凝胶阻滞的电泳迁移实验,观察 V5-c-Fos 蛋白与转录调控元件的 DNA 片段的 结合,结果显示 V5-c-Fos 蛋白并未与调控元件直接结合。提示 c-Fos 蛋白可能以间 接方式与转录调控元件结合。结论:本研究鉴定了人 SCN3A 基因的最小功能启动子及其上游调控区的功能, 发现在转录起始点上-558 到-549 bp 范围内存在一个有功能的 c-Fos 调控元件,该元 件只有在 NGF 存在的情况下才具有增加 SCN3A 启动子活性的功能,提示 c-Fos 对 SCN3A 基因的表达调控需要 NGF 的参与。关键词:转录调控元件,转录因子,c-Fos, SCN3AFunctional analysis of the transcriptional regulatory element c-Fos in the promoter region of human sodium channel SCN3A GenePostgraduate:Zuying Kuang Tutor:Prof. Weiping LiaoProf. Yuesheng LongKey Laboratory of Neurogenetics and Channelopathies of Guangdong Province and the Ministry of Education of China, Institute of NeurosciencandtheSecondAffiliated Hospitalof Guangzhou Medical University, 250 Chang-Gang-Dong Road, G
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