gcms代谢组学方法筛选造血干细胞移植后的agvhd代谢标志物的分析-analysis of screening agv hd metabolic markers after hematopoietic stem cell transplantation by gcms metabonomics method.docx

中文摘要GC-MS代谢组学方法筛选造血干细胞移植后的aGVHD代谢标志物的研究至 60 天：乳酸，丙酸，缬氨酸，尿素，甘氨酸，丝氨酸，山梨醇，葡萄糖，肌醇，丙二醇，α-生育酚, 羟基乙酸，2,3-二羟基丁酸乙酯。（5）应用 GA 算法分别对不同时间点所有化合物信息进行计算，每个时间点计 算 5 次，取位次靠前的十种化合物，其结果分别是：移植后 7 天内：丙氨酸，3-羟丁入出酸，甘油，苯丙氨酸，山梨醇，酪氨酸，油酸，鸟氨酸，磷酸，甘油酸；移植后 14 天：丙氨酸，尿素，山梨醇，尿酸，棕榈酸单甘油酯，门冬氨酸，甘油酸，甘露糖， 十五酸，花生酸；移植后 28 天：甘油，脯氨酸，甘氨酸，丝氨酸，山梨醇，亚油酸，油酸，色氨酸，磷酸，甘油酸；移植后 29 天至 60 天：乳酸，草酸，缬氨酸，甘氨酸，苏氨酸，山梨醇，肌醇，丙二醇，α-生育酚，甘油酸。将程（ ）个时间点所有化合物分别用回归方进行计算，以64Logisticα=0.05，α =0.10为标准选取各个时间点的特征代谢物，其结果为：移植后7 天内：丙氨酸，尿素，酪氨酸；移植后 14 天：山梨醇，甘油酸，十五酸；移植后 28 天：甘氨酸，山梨醇，甘油酸；移植后 29 天至 60 天：乳酸，草酸，苏氨酸，丙二醇。（7）将上述每种方法选取的特征代谢物按照时间点进行合并，每个时间点化合 物以不同的组合引入 Logistic 回归方程，计算相应的预测值，并用其绘制 ROC 曲线， 直到某个组合满足：1）ROC 曲线下组合的 p 值0.01；2）ROC 曲线的 AUC0.85； 3）ROC 曲线截点的灵敏度和特异性均70%为止，即将该组合作为这个时间点的代 谢标志物组合。最终的组合是：移植后 7 天内：丙氨酸+尿素+酪氨酸；移植后 14 天： 丙氨酸+尿素+山梨醇+尿酸+棕榈酸单甘油酯+门冬氨酸+甘油酸+正十五酸+花生酸； 移植后 28 天：丙氨酸+丝氨酸+山梨醇+油酸+甘氨酸；移植后 29 天至 60 天：乳酸+ 草酸+苏氨酸+丙二醇。其中移植后 7 天内这个时间点筛选出的组合，其 ROC 曲线的 AUC 达到 0.935，灵敏度和特异性分别达到 90.5%和 81.8%，是所有组合中对 aGVHD 的发生预测能力最强的。结论（1）基于 GC-MS 方法建立的代谢模型可以用于造血干细胞移植后 aGVHD 的预测。（2）造血干细胞移植后所选取的各个时间点均可筛选出预测和区分能力良好的aGVHD 特异的代谢标志物组合。GC-MS代谢组学方法筛选造血干细胞移植后的aGVHD代谢标志物的研究中文摘要关键词：造血干细胞移植（HSCT），急性移植物抗宿主病（aGVHD），代谢组学，代谢标志物，气象色谱质谱（GC-MS）作者：周萌 导师：孙爱宁 教授 指导老师：吴小津 副教授英文摘要GC-MS代谢组学方法筛选造血干细胞移植后的aGVHD代谢标志物的研究A pilot study of GC/MS-based serum metabolic makers of acute-graft-versus-host-disease in hematopoietic stem cell transplantationAbstractObjective: To explore the serous potential metabolic markers of aGVHD after HSCT based on GC/MS.Methods: GC/MS was used to deal with the 174 clinical samples from 61 patients which were collected right within 7 days, 14 days, 28 days, and 29 to 60 days after HSCT. AMDIS, NIST, and retention index were applied to identify the metabolites in the serum. After that, several statistics processing means were chosen to screen out the combination of metabolic markers of different time points, including OPLS-DA, t test, GA, Logistic regression, and ROC curve.Results:A stable and reliable metabolomic analysis proce