第十一章分类鉴定PPT课件.ppt

第十一章微生物的分类鉴定 据保守估计，地球上 真菌约150万种，细菌4万种，病毒130万种 但认识的微生物仅是估计数量的5~10%，即15万~20万种 要认识、研究和利用类群庞大的微生物资源， 必须对它们进行分类。 定义：按微生物的亲缘关系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群的科学。 任务：分类、鉴定、命名 命名(nomenclature)：是根据命名法规，给每一个分类群一个专有的名称； 鉴定(identification或determination)：借助于现有的微生物分类系统，通过特征测定，确定未知的、或新发现的、或未明确分类地位的微生物所应归属分类群的过程。 分类(classification)：根据一定的原则对微生物进行分群归类，根据相似性或相关性水平排列成系统，并对各个分类群的特征进行描述，以便查考和对未被分类的微生物进行鉴定； 第一节 细菌分类 一、种以上的系统分类单元 界 Kingdom 门 Phylum（或Division）——亚门 纲 Class ——亚纲 ——超目 目 Order ——亚目 科 Family ——亚科 ——族 ——亚族 属 Genus 种 Species 四、微生物的命名 命名：菌种的学名是按照《国际细菌命名法规》命名的国际学术界公认，并通用的名称。 命名原则：双名法 学名=属名+种名+（首次定名人）+定名年份 规定与常识：属名应大写首字母，种的加词代表一个种的次要特征，首字母小写，属名和种名采用斜体字。例如： 金黄色葡萄球菌， Staphylococcus aureus Rosenbach 1884 Bacillus subtilis (Ehrenberg,1835) Cohn 1872 五、细菌分类和伯杰氏手册 细菌：伯杰氏鉴定细菌学手册（第八、第九版）、细菌系统学手册（第一版） 美国宾夕法尼亚大学的细菌学教授伯杰(D.Bergey) 主编。 1957年第七版后，吸收了国际上细菌分类学家参加编写，它的近代版本反映了出版年代细菌分类学的必威体育精装版成果，因而逐渐确立了在国际上对细菌进行全面分类的权威地位。 第一版（1923年）~ 第八版（1974年） ~ 第九版（1994年） 1984~1989年改为《伯杰氏系统细菌学手册》，简称《系统手册》 (Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology) （第一版，分四卷） 第二版，分五卷 （根据系统发育资料，对分类单元进行了相当大的调整，将细菌分成两个域共25门39纲） 第一卷：古生菌、蓝细菌、光合细菌以及最早分支的细菌 第二卷：变形杆菌（包括形态及生理学特征多样的革氏阴性菌） 第三卷：低G+C含量的革氏阳性菌 第四卷：高G+C含量的革氏阳性菌 第五卷：浮霉状菌、螺旋体、丝杆菌、拟杆菌和衣原体等 伯杰氏手册是目前进行细菌分类、鉴定的最重要依据，其特点是描述非常详细，包括对细菌各个属种的特征及进行鉴定所需做的实验的具体方法。 第二节 微生物的分类系统 一、生物的界级分类学说 是在认识发展过程中存在的对生物分类的不同阶段的不同观点。 如：二界系统、三界系统、四界系统、五界系统、六界系统和三原界系统 二、三原界系统 是1978年由Wose提出的，所有生物存在一个共同祖先，由它分三条进化路线，就形成了三个原界：古细菌原界、真细菌原界、真核生物原界1990年，又改为古生菌、真细菌、真核生物 三、系统发育树定义：p331 第三节 微生物的分类鉴定方法 菌种鉴定步骤： 获得纯培养物 测定必要的鉴定指标 查找权威性的菌种鉴定手册 一、传统分类法 1、形 态 特 征： 个体形态（形状、大小、染色反应等） 群体形态（菌落特征、液体培养特点等） 2、生理生化特征： 营养要求、代谢产物、酶的反应等的测定 3、生态特征： 微生物间各种相互关系的利用 温度、氧气、PH等 二、遗传分类法 1、G+C含量的测定 由于微生物（G+C）mol%具有较稳定的值，可代表其遗传特征。一般而言，亲缘关系密切和表型又高度相似的微生物常有相似的（G+C）mol% a）每个生物种都有特定的GC%范围，因此后者可以 作为分类鉴定的指标。细菌的GC%范围为25-75%， 变化范围最大。 b）GC%测定主要用于对表型特征难区分的细菌作 出鉴定，从分子 水平上判断物种的亲缘关系。 c） GC%的比较，主要用于分类鉴定中的否定. 亲缘关系近的生物，它们应该具有相似的G+C含 量，但