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测序仪数据收集软件.ppt

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测序仪数据收集软件

ABI测序仪数据收集软件 技术服务部 一、常用软件 Data collection 3.0(310) Data collection 1.0(3100a) Data collection 2.0(3100、3130、 3130XL) 二、需要注意的要点 Dye set的选择 Run module的选择 Sample sheet的填写 正确的光谱校正 Result group 的设置 三、Data collection 3.0 1、Sample sheet 需注意的事项 Sample name是必须填写的。 Matrix 校正时,用于标记Std的黑色方块需去掉。 右上角的燃料组合方式需选明。 48孔板的样品写入顺序。 2、Injection list 注意事项 首先选中所建的Sample sheet。 Operator Run module: GS STR POP4(1ml)D Matrix file:选中正确的Matrix file 其它保持默认值 3、染料组合 4、常见Module选项 5、必需要用GeneMapper作光谱校正 要将生成的Matrix文件倒入Data collection3.0,路径是D:\AppliedBio\Shared \Analysis\Sizecaller\Matrix 6、Result group设置 四、 Data collection 1.0 上图为Data colection1.0主界面选项,点击Plat ViewNew可进入Plate Editor对话框。 Plate View界面 1、Matrix的生成 要点 (1)选中正确的Dye set (2)moduel的选择 进入Plate Editor编辑框 填写样品表 需填写的项 sample name dye set:D run modele:Spect36_POP4DefaultModule Spectral Parameters :MtxStd﹛GeneScan-SetD﹜.par 连接样品板 Run View Status View 电泳分析完成后,出现光谱校正结果对话框。 查看以前的光谱校正 2、样品电泳 首先编辑Plate Editor 填写样品表 需填写的项 样品名 dye set:D run module:GeneScan36_POP4DefaultModule Color info:填写与样品名一样的名字 ,客户习惯全部填写上。 project必须填写。 3、Resule group 设置 样品表填写完成后,回到Plate View主界 面,连接样品表,开始电泳。 谢谢大家,欢迎讨论。 * *

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