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基因概念和结构
精氨酸的代谢过程和酶作用位置 谷氨酸 argE酶 鸟氨酸 argF酶 瓜氨酸 argG酶 精氨琥珀酸 argH酶 精氨酸 6)长开放阅读框法: 开放阅读框:含有起始密码、一般密码,但不 含有终止码的DNA序列。 大于100个氨基酸的序列可能是一个基因 非编码序列中终止密码出现机率为3/64,即每 21个密码子就有一个终止码 不含终止密码且长度为N个密码子的序列出现的 机率为(61/64)N, 当N等于60时: (61/64)60=0.05,即 95﹪的显性置信度,5﹪的 随机命中基因的可能性 二、基因的大小、数目、结构 1、基因的大小 真核生物的基因比较大,如哺乳动物的基因可达 100kb,很少有小于2000bp的,大多在5---100kb 之间。在分析一段DNA序列时,如果小于100个密 码子的就不能看作一个基因 原核生物的基因比较小,如¢X174的K基因仅仅167 个核苷酸。 基因的大小取决于基因中内含子的数目,取决于 内含子的长短,一般内含子是外显子的5--10倍 不同生物的平均基因大小 种类 平均 平均 平均 外显子数目 基因长度kb mRNA长度kb 酵母 1 1.6 1.6 真菌 3 1.5 1.5 藻虫 4 4.0 3.0 果蝇 4 11.3 2.7 鸡 9 13.9 2.4 哺乳动物 7 16.6 2.2 2、基因的数目 1) 计算基因数目的方法 通过基因表达测算:不准确 通过突变分析测算:若某区段充满致死突变, 则测定此染色体区段的致死位点数量, 然后据此推出整个基因组中基因的数目 通过基因密度测算: 测基因组的序列,然后测 出平均每个开放阅读框的大小,测出每个阅读框 之间的间隔,计算出基因的数目。例如酵母菌的 基因组全长为12000 kb ,平均每个阅读框长度 为1.4kb,基因间间隔平均为600bp,基因数目为 6000个 2 ) 不同生物的基因数目 种类 基因组大小(bp) 基因数目 ¢X174 5386 11 枝原体 1.0×10 6 750 T4噬菌体 1.6×105 200 大肠杆菌 4.2×106 4288 酵母 1.3×10 7 6000 果蝇 1.4×108 8750 水稻 4.6×108 45000 人类 3.0×10 9 35000 3、基因的结构 1)原核生物基因的结构
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