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基因组与蛋白组学技术2015蛋白质组学方法在神经科学中应用
蛋白质组学方法在神经科学中的应用
马珊珊
中山医学院药理教研室
1
DNA RNA 蛋白质 降解
生命活动的直接执行体
蛋 白 质 组
蛋白质组 (proteome )
一种细胞、组织或完整的生物体所表达的全套蛋白质。
蛋白质组学(proteomics)
从整体水平研究细胞内蛋白质的组成及其变化规律。
蛋白质组学是前沿交叉学科
前沿性——国际热点
交叉性——原始创新机会
共享性——创新性技术平台,辐射多学科
5
Parkinson disease (PD)发病情况
6
全球: 总人口 0.3%
60岁 1%
我国: 200万
神经退行性疾病
锥体外系 运动障碍
PD病程长、危害大
7
PD是世界各国关注的热点
8
973计划资助
2006年《神经变性病的机制和防治的基础研究》
2011年《帕金森病发病机制和干预策略的基础研究》
PD病因及发病机制
年龄
环境
遗传
氧化应激
线粒体功能缺陷
泛素-蛋白酶体功能异常
9
PD病理特点
10
DA神经元选择性、进行性死亡
路易小体形成
PD病理特点
11
静止性震颤、肌肉僵直、运动迟缓和姿势步态异常
临床表现
PD病程
13
PD诊断
临床表现为主 影像学辅助
14
Lancet 2009
60% DA die before diagnosis of PD
The Lancet Neurology. 2007
16
PD的预警与早期诊断
早期诊断
生物标记物
影像学诊断
分子探针
VMAT2显像
Aβ 显像
SERT 显像
蛋白质组学
高通量筛选
PD病人血清蛋白质组学
人血清中高丰度蛋白的去除和低丰度蛋白组学研究
Time (min)
%B
Flow rate
Max.pressure
1
0.00
0.00
0.125
60
2
9.50
0.00
0.125
60
3
9.51
0.00
1.00
60
4
11.50
0.00
1.00
60
5
11.51
100.00
1.00
60
6
16.00
100.00
1.00
60
7
16.01
0.00
1.00
60
8
25.00
0.00
1.00
60
Table 1. LC timetable for low-abundant protein separation
17
差异蛋白:ITIH4和APO A-IV片段
ITIH4
(n=20)
APO A-IV
(n=20)
33
扩大样本到100例以上
19
ITIH4 120 kDa 全长↑, 35 kDa 片段↓
29%
18%
69%
20
Kallikrein ?
MMP-7 ?
ITIH4和Apo A-IV变化的机制
PD病人血清Kallikrein↓ MMP-7↑
22
30%
39%
N=130
N=50
PD
PD治疗
药物治疗为主
左旋多巴
多巴胺受体激动剂
单胺氧化酶抑制剂
外科手术
深部脑刺激 DBS
细胞治疗
ESC
iPSC
23
3~5年失效
副作用
神经毒性?
PD治疗瓶颈
24
研究思路
环境、老化、遗传
25
DA神经元死亡/PD发生
信号转导
关键分子/靶标
干预手段
GSK-3β与PD密切相关
GSK-3β
MPTP/PD动物: GSK-3β 介导DA神经元死亡
29
Nature 1995
Mol Cell Biol 2000
J Biol Chem 1995
GSK-3是介导神经元死亡的汇聚点
去极化介导CGNs神经元存活
GSK-3α/β促神经元凋亡
GSK-3α/β促神经元凋亡
GSK-3α和GSK-3β均促凋亡
去极化介导GSK-3磷酸化并抑制其活性
Ser21/9磷酸化是凋亡关键位点
意 义
39
Ser9磷酸化调控
41
Calpain切割调控
J Biol Chem 2007
42
43
不仅N,而且C末端被切割
44
体外切割一
J Biol Chem 2007
45
体外切割二
46
Flag-GSK-3β-V5
结 论
神经元死亡时,calpain不仅切割GSK-3β N末端还切割其C末端
Ser9磷酸化抑制N、C末端切割,Ser389磷酸化抑制C末端切割
GSK-3β C末端像N末端一样有自身抑制作用
47
Ser9磷酸化与切割的关系?
48
Se
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