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miRNAs相关基因单核苷酸多态性与胃癌相关性研究进展
miRNAs相关基因单核苷酸多态性与胃癌相关性研究进展
[摘要] 微小RNA(miRNAs)是一类内源性非编码单链核苷酸小分子RNA,能在转录后水平对靶基因的表达进行调控,这种特异的基因表达调控方式对疾病的发生、发展及预后都起着重要的作用。近年研究发现miRNAs与胃癌的发生、发展、治疗及预后密切相关,而且miRNAs内单核苷酸多态性(SNP)对其功能的发挥具有重要影响,因此miRNAs的SNP与肿瘤发生的相关性成为肿瘤分子流行病学的研究热点之一。本文就近年来与胃癌相关的miRNAs及SNP的研究进行综述,并对今后的研究方向进行展望。
[关键词] 微小RNA;基因多态性;胃癌
[中图分类号] R735.7 [文献标识码] A [文章编号] 1673-7210(2013)06(a)-0037-03
微小RNA(miRNAs)是一类广泛存在于真核生物细胞内的小分子RNA,其长度为19~23个核苷酸。研究显示,其生物学功能十分广泛,如具有调节细胞凋亡、细胞分化和细胞增殖[1]等生理作用。miRNAs与其调控的靶mRNA互补配对,使靶mRNA降解,从而在转录后水平对基因的表达进行调控。临床及基础研究已经证实miRNAs的表达异常,可以调节抑癌基因的表达亦可激活原始致癌基因的表达,从而导致肿瘤的发生[2]。研究显示不同部位的肿瘤在肿瘤发生的不同阶段具有特定的miRNAs表达模式,提示miRNAs具有肿瘤抑制因子或致癌因子的功能。编码miRNAs的基因内存在单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),这些SNP具有特定的生物学,可以调控miRNAs的表达及影响其调控功能,进而与肿瘤的发生和发展密切相关[3-5]。现有研究发现,miRNAs编码基因中的SNPs与胃癌的发生、发展、治疗及预后密切相关。本文就近年来对miRNAs相关的SNPs与胃癌的关系的研究进展进行综述。
1 miRNA相关的SNP简介
基因组内特定核苷酸位置上存在2种不同的碱基,其中最少1种在群体中的频率不小于1%,这种基因组的单个位点上的碱基的差异称之为SNPs。SNPs是存在于人群体中每个个体的基因序列细微差别,在整个人类基因组中分布相当广泛。虽然大多数SNPs并不影响基因的功能,但一些特定区域的SNPs可以使人易患疾病或影响对药物的敏感性。
研究显示,一些SNPs的存在对miRNA功能发挥有着显??的影响,依据其影响其调控靶基因方式的不同分为三类:①SNPs位于编码miRNA的区域,这些SNPs可通过3种方式影响miRNA的调节功能产生作用,即:调控pri-miRNA转录、影响pri-miRNA到pre-miRNA的加工及成熟、影响miRNA与靶基因结合;②SNPs存在于miRNA结合的DNA序列中,这些SNPs可以通过减少miRNA的结合位点或导致错误的miRNA结合位点,从而影响miRNA与靶序列结合的亲和力,导致调控的失常[6-7]。③SNPs位于miRNA的加工成熟相关的基因中。miRNA从转录到发挥调控功能要经过复杂的生物学加工过程:miRNA基因的初级转录产物(pri-miRNA)在细胞核中被RNase Ⅲ Drosha切割成为前体miRNA(pre-miRNA)。在最初的剪切后,pre-miRNA在转运蛋白exportin-5的作用下由核内转到胞质中,然后由另一种RNase Ⅲ Dicer进一步切割产生成熟的miRNA。这些成熟的miRNA与其他蛋白质一起组成RISC(RNA-induced silencing complex)复合体,从而引起靶mRNA的降解或者翻译抑制。在这个过程中有众多的生物分子参与,如:GEMIN3、GEMIN4、XPO5、RAN、AGO1、DDX20、RNASEN等基因miRNA成熟过程中的关键分子。这些基因中的SNPs也同样会影响到miRNA生物学功能的发挥,进而与多种肿瘤的发生及预后相关[8]。
2 miRNA相关的基因多态性与肿瘤关系的研究进展
miRNA SNPs是近年来分子流行病学研究的热点,在包括乳腺癌、食管癌、肝癌等多种肿瘤都能发现有其相关的miRNA SNPs[9]。在与胃癌相关的miRNA SNPs的研究尚在数据积累阶段,现就近年有关胃癌的miRNA SNPs 的研究进展列述如下:
2.1 miR-146a
研究显示,miR-146a通过与白介素-1受体相关激酶(interleukin receptor associated kinase,IRAK1)、肿瘤坏死因子受体相关因子6(tumor necrosis factor receptor-associated factor 6,TRAF6)、NF-
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