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分子生物学复习的资料
概念
分子生物学广义:指从分子水平研究蛋白质、核酸等生物大分子的结构与功能,从而阐明生命现象本质的科学。
生物大分子:核酸(Nucleic acid) 、蛋白质(Protein)、多糖(Amylose)等具有重要功能的较大分子量物质。
基因组(genome):生物机体一个细胞所有不同染色体上全部的DNA总和称为基因组。
模式生物(Model Organism):指在研究生物生命活动基本规律的过程中,为了研究方便和可行所选用的一些特定物种。
模式生物生命周期短 成体小方便易得可追溯性
基因敲除(gene knock out)又称基因剔除
是将一个结构已知而其功能未知的基因去除,或者用其它顺序相近的基因取而代之的人工突变技术,然后从整体观察实验生物,推测相应基因的功能。
维持蛋白质、核酸空间结构中重要的化学键
(1)非共价键氢键离子键 范德华力疏水作用
(2) S-S键(共价键)-SH间形成
蛋白质的二级结构是指多肽链主链的折叠和盘绕方式。呈有规律的空间排列。(以α–螺旋和β-折叠最常见)α-helix0.23 nm diameter 3.6 aa per turn hydrogen bond 0.54 nm pitch (螺距)
无规卷曲: 无规卷曲是指没有规律性的肽链结构,在特定的蛋白质中也是一种特定的结构。
许多蛋白质的功能部位常常埋伏在这里,如酶的活性部位。
超二级结构是1973年Rossmann提出的,它是指二级结构的基本结构单位(α-螺旋,β-折叠等)相互聚集,形成有规律的二级结构的聚集体。
已知的超二级结构主要有αα,βxβ,β-曲折和β-折叠筒等。
结构域是球状蛋白质的折叠单位,多肽链折叠的最后一步是结构域的缔合。
每个结构域都有其特定的生物学功能。
模体(motif) :两个或三个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成具有特殊功能的空间结构。
亚基是指一条多肽链或以共价链连接在一起的几条多肽链组成的蛋白质分子的最小共价结构单位。
Q1、常见的生物大分子有核酸、 和 等主要种类。
Q2、蛋白质的二级结构是指多肽链主链的折叠和盘绕方式,以 和 最为普遍。
B-DNA:为右手螺旋模型,每圈螺旋10个碱基,螺旋扭角为36度。(最常见)
A-DNA:为右手螺旋,每圈螺旋10.9个碱基,螺旋扭角为33度。(脱水;比B短、宽)
Z-DNA:为左手螺旋,每圈螺旋12个碱基,螺旋扭角为-51度(G—C)和-9度(C—G)。
Z-DNA的形成原因时发现DNA的序列如果在短距离之间出现14次以上CG的重复序列,则有很高的机会形成Z-DNA的分子结构。
核糖体RNA:即rRNA,是最多的一类RNA,也是3类RNA中相对分子质量最大的一类RNA,它与蛋白质结合而成核糖体,其功能是作为mRNA的支架,使mRNA分子在其上展开,实现蛋白质的合成。rRNA占整个RNA的82%左右。rRNA是细胞中含量最多的RNA,约占RNA总量的82%。rRNA单独存在时不执行其功能,它与多种蛋白质结合成核糖体,作为蛋白质生物合成的“装配机”。
复性:退火处理(慢速冷却)使得互补链互相配对,恢复双链结构
退火( Annealing): DNA由单链复性变成双链结构的过程
杂交(Hybridization): 不同核酸链之间的互补部分的复性
减色效应: 核酸复性时,紫外吸收降低,由于核酸复性而引起紫外吸收降低的现象。
增色效应: 由于核酸变性而引起紫外吸收增加的现象。
半保留机制DNA 双链解开,以单链做模板,碱基互补原则,各自合成一条子链
DNA半保留复制的生物学意义:
DNA的半保留复制表明DNA在代谢上的稳定性,保证亲代的遗传信息稳定地传递给后代。
Replicon 复制子能进行复制的DNA 单位,从起始位点到终止位点的全部DNA.
Origin(复制起始位点) is the DNA sequence where a replicon initiates its replication. A-T rich.)
Terminus(复制终止点) is the DNA sequence where a replicon usually stops its replication
replication forks(复制叉): 在复制启动时,尚未解开螺旋的亲代双链同新合成的两条子代双链DNA的交界处。
replication bubbles(复制泡):两个靠得很近的复制叉之间形成的空间。
?半不连续复制概念:
在DNA复制过程中,亲代DNA分子中以3’ 5’方向的母链作为模板指导新的链以5’ 3’ 方向连续合成,另一股以5
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