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毕业设计(论文)-基于反向找的天然产物活性研究
PAGE \* MERGEFORMAT16基于反向找靶的天然产物活性研究摘 要利用计算机辅助药物设计(CADD)技术对Chinese Bittersweet Alkaloid (1) and (2)、Pubesenside A、2-氟代腺苷和腺苷的潜在靶标进行预测并对预测结果进行进一步的验证与分析。采用Pharmmapper网络服务器进行初步预测,并结合文献进行筛选与验证,然后采用Discovery Studio3.0(以下简称DS3.0)对靶蛋白与Chinese Bittersweet Alkaloid (1) and (2)、Pubesenside A、2-氟代腺苷和腺苷分子进行对接并对其相互作用进行进一步分析与讨论。结果Pharmmapper筛选结果显示Chinese Bittersweet Alkaloid (1) and (2)与表皮生长受体(Epidermal growth factor receptor以下简称EGFR)的结合较好,Pubesenside A与血管内皮生长因子受体2(Vascular endothelial growth factor receptor 2以下简称VEGFR-2)的结合较好,2-氟代腺苷和腺苷与β-内酰胺酶(Beta-lactamase)的结合较好。查阅文献发现EGFR是当前药物治疗非小细胞癌症的主要靶标,例如厄洛替尼、吉非替尼等 ADDIN EN.CITE EndNoteCiteAuthor刘慧慧/AuthorYear2013/YearRecNum66/RecNumDisplayText[1]/DisplayTextrecordrec-number66/rec-numberforeign-keyskey app=EN db-id=we2rwsatuw5we1esxxl5ttv2eer2rpaze0fw66/key/foreign-keysref-type name=Journal Article17/ref-typecontributorsauthorsauthor刘慧慧/authorauthor王孟昭/authorauthor胡克/authorauthor徐燕/authorauthor马满姣/authorauthor钟巍/authorauthor赵静/authorauthor李龙芸/authorauthor王华竹/author/authors/contributorsauth-address中国医学科学院北京协和医院呼吸内科;中国医学科学院北京协和医院放疗科;/auth-addresstitlestitleEGFR-TKI在非小细胞肺癌中耐药机制的研究进展/titlesecondary-title中国肺癌杂志/secondary-title/titlesperiodicalfull-title中国肺癌杂志/full-title/periodicalpages535-540/pagesnumber10/numberkeywordskeyword肺肿瘤/keywordkeywordEGFR/keywordkeywordEGFR酪氨酸激酶抑制剂/keywordkeyword耐药/keyword/keywordsdatesyear2013/year/datesisbn1009-3419/isbncall-num12-1395/R/call-numurls/urlsremote-database-providerCnki/remote-database-provider/record/Cite/EndNote[ HYPERLINK \l _ENREF_1 \o 刘慧慧, 2013 #66 1];VEGFR-2是当前治疗肾癌的主要靶标,例如索拉菲尼等;Beta-lactamase是著名抗生素-青霉素的靶标。DS3.0的对接结果也显示Chinese Bittersweet Alkaloid (1) and (2)尤其是(2)与EGFR具有静电作用、氢键、范德华力、Pi——Pi键等相互作用;Pubesenside A与VEGFR-2之间具有静电作用、氢键、范德华力等相互作用;2-氟代腺苷和腺苷尤其是2-氟代腺苷与Beta-lactamase之间具有静电作用、氢键、范德华力、Pi键等相互作用。本次实验就Chinese Bittersweet Alkaloid (1) and (2)与厄洛替尼相比较分别与EGFR进行分子对接;Pubesenside A与索拉菲尼相比较并与VEGFR-2进行分子对接;2-氟代腺苷和腺苷与青霉素相比较并分别与青霉素进行分子对接。并比较得出结论:Chinese Bittersweet Alkaloid (1) and (2)的潜在靶标最有可能是EGFR。而且无论是在
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