浅谈分子动力学模拟.pptx

浅谈分子动力学模拟;内容;MD模拟的发展历程;经典力学;两个基本假定;量子力学; 统计力学（统计物理学）是研究原子、分子集合的宏观运动规律的科学，根据对物质微观结构及微观粒子相互作用的认识，用概率统计的方法，对由大量粒子组成的宏观物体的 物理性质及 宏观规律作出微观解释的理论物理学分支。;什么分子动力学模拟？;分子动力学简史;分子动力学模拟方法;分子动力学方法特征：;MD的理论依据是什么？;分子动力学方法基本原理：;分子动力学----牛顿运动方程式的数值解法;2.有限差分法;蛙跳算法;?. 计算当前时刻的速度：;优点： 1、提高精确度 2、轨迹与速度有关，可与热浴耦联;MD模拟参数及注意事项;分子动力学模拟参数及注意事项; 含义：只模拟实际物质中很小一部分，使模拟体系成为无限的具有相同性质的分子体系的，该部分在三维空间中周期性的存在，代表整个体系。 ;2.势函数;3.系综;4.积分步长的选取;1.对于N个原子的系统，每计算一步需要计算1/2N(N+1)组远程作用力，这是运算过程中最耗时的部分，若原子增加一倍，计算时间则为1/2×2N(2N+1)为原来的四倍多。;实例分享;Al2O3;谢谢大家！