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生物化学讲义
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第一章 蛋白质化学(12学时)
【基本要求】:
掌握蛋白质的基本单位-氨基酸的种类、结构特征及其主要的理化性质。
掌握蛋白质的一二三四级结构以及稳定其结构的重要作用力。
掌握蛋白质的重要性质(两性解离、变性、沉淀、紫外吸收、颜色反应)。
【内容提要与学时分配】? 1.蛋白质的生物学功能(1)?? 2.蛋白质的元素组成与分子组成(2)???
?3.蛋白质的分子结构(4)?? 4.蛋白质结构与功能的关系(2)???
? 5.蛋白质的理化性质(2)? 6.蛋白质的分类与分离纯化简介(1)
第一节 蛋白质通论
一、蛋白质的生物学意义(160)
蛋白质是生命的体现者——恩格斯语。Protein — “第一重要的”,“最原初的”。
概括起来,蛋白质主要有以下功能:
1.催化功能(Enzyme) 2.调节功能 3. 运动功能 4. 运输和跨膜转运功能
5. 保护和防御功能 6. 信息传递与识别功能 7. 贮存功能 8. 结构功能
二、蛋白质的分类(158)
(一)按分子形状分类 1.球状蛋白 2.纤维状蛋白
(二)按分子组成分类
简单蛋白:清蛋白、球蛋白、组蛋白、精蛋白、谷蛋白、醇溶蛋白和硬蛋白。
缀合蛋白:核蛋白、脂蛋白、糖蛋白、磷蛋白、血红素蛋白、黄素蛋白和金属蛋白。
三、蛋白质的元素组成与分子量(157)
元素组成
蛋白质平均含碳50%,氢7%,氧23%,氮16%。其中氮的含量较为恒定,而且在糖和脂类中不含氮,所以常通过测量样品中氮的含量来测定蛋白质含量。
如常用的凯氏定氮法:蛋白质含量=蛋白氮×6.25(即100/16)。
2.蛋白质的分子量 蛋白质的分子量变化范围很大,从6000到100万或更大。
四、蛋白质的水解(123)
蛋白质的水解主要有三种方法:
1.酸水解 2.碱水解 3.酶水解
第二节 氨基酸( amino acid)
一、氨基酸的结构与分类(124)
(一)基本氨基酸
组成蛋白质的20种氨基酸称为基本氨基酸,或称为常见氨基酸、蛋白质氨基酸。
基本氨基酸都符合通式,都有单字母和三字母缩写符号。
一般结构特征:
它们中除脯氨酸外都是α-氨基酸,即在α-碳原子上有一个氨基。
不同的氨基酸,其R侧链不同,对氨基酸的理化性质和在结构中的影响也不同。
天然氨基酸都是L-构型的,即羧基在上,氨基在左端。若氨基在右为D-构型(与标准甘油醛的构型参照得出的)。
A.按照氨基酸侧链的极性分类(127):
非极性氨基酸:Ala, Val, Leu, Ile, Met, Phe, Trp, Pro共八种
极性不带电荷:Gly, Ser, Thr, Cys, Asn, Gln, Tyr共七种
带正电荷:Arg, Lys, His
带负电荷:Asp, Glu
按照氨基酸侧链的化学结构,分为三类:脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸和杂环氨基酸。
1.脂肪族氨基酸 共15种。
侧链只是烃链:Gly, Ala, Val, Leu, Ile。侧链含有羟基:Ser, Thr
侧链含硫原子:Cys, Met 侧链含有羧基:Asp(D), Glu(E)
侧链含酰胺基:Asn(N), Gln(Q) 侧链显碱性:Arg(R), Lys(K)
2.芳香族氨基酸 包括苯丙氨酸(Phe,F)、色氨酸(Trp,W)和酪氨酸(Tyr,Y)三种。
3.杂环氨基酸 包括组氨酸(His)和脯氨酸(Pro)种。
(B是指Asx,即Asp或Asn; Z是指Glx,即Glu或Gln。)
照酸碱性分类:
酸性氨基酸:Asp, Glu
碱性氨基酸:Arg, Lys, His
中性氨基酸:15种
还有两种新发现的氨基酸: 硒代半胱氨酸(Sci 2002.5.24) 吡咯赖氨酸
小结:2酸—3碱—3芳香—2含S—2含OH—2酰胺
甘Gly(最特殊,唯一无旋光性)、丙Ala(顾名思义)//苯丙Phe(顾名思义)、
酪Tyr(有β-苯酚基)、色Trp(β-吲哚基P66) // 甲硫Met(γ-甲硫基)、
半胱Cys(β-巯基)、丝Ser(β-羟基)、苏Thr(β-羟基) // 天冬Asp(酸性氨基酸,β-羧基)、天冬酰氨Asn(β-酰氨)、谷Glu(酸性氨基酸,γ-羧基)、谷氨酰氨Gln(γ-酰氨)// 精Arg(δ-胍基P66)、赖Lys(ε-氨基)、组His(β-咪唑基P66)//缬Val、亮Leu、异亮Ile:都是烷烃链 // 脯Pro(亚氨基)。
(二)不常见的蛋白质氨基酸(128)
某些蛋白质中含有一些不常见的氨基酸,它们是基本氨基酸在蛋白质
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