三种猫科动物MHCClass!DRB等位基因序列变异性分析Sequence.PDF

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三种猫科动物MHCClass!DRB等位基因序列变异性分析Sequence

动 物 学 研 究 , (): !# $% ’ !( ! )*) + )** ,- ./ + )01 2 344- !.0 + .*./ 5667689:;7 ==;:? 三种猫科动物@A, ,7; ! BC 等位基因序列变异性分析 王 倩,吴孝兵 ,晏 鹏 (安徽师范大学 生命科学学院重要生物资源保护与利用安徽省重点实验室,安徽 芜湖 ! #$$$ ) : 摘要 分析了云豹 ( )、豹 ( )和东北虎 ( )等 种猫 !#$ %’ ()*%#’+ ,+(-./+ 0 +/1*’ ,+(-./+ -2/’ +%-+3+ % 科动物的主要组织相容性复合物’()) ! *+, 座位的等位基因序列变异性。使用一对简并性引物扩增了*+, 座 位第二外元目标片段。用单链构像多态性分析方法确定不同的单倍型。每个个体挑出#- 个单克隆用来分离、 纯化和测序。实验中从 个个体中获得了 种不同序列。 核苷酸序列中发现有 个变异位点。根据人类 . !%/ 01 -2 的抗原肽结合区推测 个氨基酸位点中存在 个假定的抗原肽结合位点,而且非同义替换率明显高于同义替 /2 !# 换率,这可能说明了第二外元的较高变异性是由平衡选择作用来维持的。重建的 树和 树显示豹和东北虎 34 56 的亲缘关系较近,而两者与云豹的亲缘关系较远。 关键词: 基因; 座位;第二外元;猫科动物;变异性 57 *+, 中图分类号: ; 文献标识码: 文章编号: ( ) 82-2 9 .%. 82-2 9 .%. 9$% : $!- ; -.-% !$$ $! ; $#.# ; $. 4=DE=F:= G;9;H979IJ $F;7J9 6K @A, ,7; ! BC $77=7= 9F L?== M=79F= !#$ %’( ) ! * +’,- .(/ ) 0# 12(/ 4 5(.* 67 8+)#/+-#/7 #$ 9#(’/:+-#( +(1 ;0 %#/+-#( $ #/ =0 #/-+(- ?#/’#*/3’ @ 9#%%2 #$ 8$ A3(3’ @ 5(.* !#/+% B(:/’-7 @ C*.* ! #$$$ @ 9.(+D $HI;:I N =? @(AB(CBDE DF C? ?GDE ! DF C? H(I

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