抗HIV融合抑制剂的定量构效关系-北京工业大学学报.PDF

第39卷 第2期 北 京 工 业 大 学 学 报 Vol.39 No.2 2013年 2月 JOURNAL OF BEIJING UNIVERSITY OFTECHNOLOGY Feb. 2013 抗HIV 融合抑制剂的定量构效关系 谭建军,王摇 遥,王存新 (北京工业大学 生命科学与生物工程学院,北京摇 100124) 摘摇 要:利用三维定量构效关系研究抗HIV融合抑制剂和受体(跨膜蛋白gp41)的结构-活性关系. 基于具有活性 的抑制剂,用易位体比较分子场分析方法(topomer comparative molecularfield analysis,Topomer CoMFA)方法建立抑 制剂结构与活性之间关系的数学模型,并利用统计分析,评价与分析模型的预测能力,结果表明该模型具有较好的 预测能力. 研究结果可为未知化合物的活性预测、苗头化合物的结构改造、新化合物实体的设计提供理论指导. 关键词:融合抑制剂;跨膜蛋白gp41;艾滋病病毒;三维定量构效关系;易位体比较分子场分析方法 中图分类号:R91 文献标志码:A 文章编号:0254-0037(2013)02-0309-05 Quantitative Structure鄄Activity Relationship of Anti鄄HIV Fusion Inhibitors by Topomer CoMFA TANJian鄄jun,WANG Yao,WANG Cun鄄xin (College of Life Science and Bioengineering,Beijing University of Technology,Beijing 100124,China) Abstract:The gp41 inhibitors were selected as targets to investigate the interactions between gp41 inhibitors and the structure of small molecules using topomer comparative molecular field analysis (CoMFA) methods. The small molecule inhibitors are chosen from the literatures, and the molecule modelwasconstructedbyusingTopomer CoMFA. Then,thepredicativeabilityofthemodelwasanalyzed according to the statistical method and an ideal prediction model is obtained. These results may give guidance inthefutureresearchincludingtheactivitypredictionofthecompounds,thestructuremodify of molecules,and drug design. Key words: fusion inhibitor; gp41; HIV; 3D鄄QSAR; topomer comparative molecular field analysis (Topomer CoMFA) [2鄄3] 摇 摇 HIV-1病毒的整个生命周期中,由跨膜糖蛋白 膜融合过程中的重要步骤 . gp41介导的膜融合过程是 HIV-1病毒入侵宿主细 阻止跨膜糖蛋白