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基于对称不确定性和邻域粗糙集的肿瘤分类信息基因-数据采集与处理
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ISSN10049037CODENSCYCE4 htt sc.nuaa.edu.cn
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JournalofDataAcuisitionandProcessin Vol.33No.3Ma 2018 .426-435 Emailsc nuaa.edu.cn
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DOI10.16337 .10049037.2018.03.005 TelFax+86025
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2018b JournalofDataAcuisitionandProcessin
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基于对称不确定性和邻域粗糙集的肿瘤分类信息基因选择
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叶明全 高凌云 伍长荣 黄道斌 胡学钢
( 皖南医学院医学信息学院,芜湖, ; 皖南医学院健康大数据挖掘与应用研究中心,芜湖, ;
1. 241002 2. 241002
安徽师范大学计算机与信息学院,芜湖, ; 合肥工业大学计算机与信息学院,合肥, )
3. 241002 4. 230009
摘 要:基因表达谱中信息基因选择是有效建立肿瘤分类模型的关键问题。肿瘤基因表达谱具有高维
小样本、噪声大且存在大量无关和冗余基因等特点。为了获得基因数量尽可能少而分类能力尽可能强
的一组信息基因,提出一种基于对称不确定性和邻域粗糙集的肿瘤分类信息基因选择 SUNRS方法。
首先利用对称不确定性指标评估信息基因的重要度,以剔除大量无关和冗余基因,获取信息基因的候选
子集;然后利用邻域粗糙集约简算法对信息基因候选子集进行寻优,获得信息基因的目标子集。实验结
果表明, 方法能够用较少的信息基因获得更高的分类精度,从而既能改善算法的泛化性能,又能
SUNRS
提高时间效率。
关键词:基因表达谱;邻域粗糙集;对称不确定性;特征选择;肿瘤分类
中图分类号: 文献标志码:
TP18 A
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