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如何进行蛋白质中肽链肽键氨基羧基数氮和氧原子数计算的授课
如何进行蛋白质计算的授课
00waterh 爱小玉出品
蛋白质的计算是蛋白质教学中比较难的一个知识点。学生必须掌握了脱水缩合,
二肽,肽键,三肽,多肽,多肽链等的基础上才会做有关蛋白质计算的题。因此蛋
白质的计算一般放在蛋白质这一节的最后讲。蛋白质的计算可以归纳为三个方面:
1.由脱水缩合形成肽链中的数量关系;2 蛋白质中游离氨基或羧基的计算;3.蛋白质
中所含N ,O 原子的计算。那么如何开展课堂教学呢?
首先给学生展示一个习题(见图 1):
学生很容易得出脱去了 3 分子水,形成了 3 个肽键。该条多肽的相对分子质量
为:4 ×a−18(4-1)。那么假设 1 条肽链由 n 个氨基酸组成的情况又是怎样呢?学生
也能得出脱去(n-1)分子水,形成(n-1)个肽键,多肽的相对分子质量为a×n-18
×(n-1)。
那如果是 1 个蛋白质由多条肽链的情况又会怎么样呢?此时教师可以在黑板上
板书2 条肽链的情况(如下图2)。
可见,2 两条肽链共脱去(n-2 )分子水,形成(n-2 )个肽键,多肽的相对分子
质量为 a ×n-18×(n-2)。那假设由n 个氨基酸形成了m 条肽链,情况会是怎么样呢?
学生自然会得出 m 条肽链共脱去(n-m)分子水,形成(n-m)个肽键,形成的多肽
链的相对分子质量为a×n-18×(n-m)。
紧接着让同学们看一个例题(如下图 3):
告诉学生这是氨基酸形成的环状肽链,那该化合物是由几个氨基酸脱去几分子
水形成几个肽键组成的?学生通过观察会发现是由 5 个氨基酸,脱去 5 分子水,形
成 5 个肽键组成的。继续追问如果有 n 个氨基酸形成的 1 条环状链,会脱去几分子
水,形成几个肽键。学生自然能够回答脱去 n 分子水形成 n 个肽键。
接下来给学生展示一条氨基酸链,来讲解游离氨基(-NH2 )和游离羧基(-COOH )
(见下图4 )。可问学生一条肽链中的氨基和羧基数是多少?学生容易想到肽链的一
端有 1 个,其余的可能在 R 基中,R1 基中可能有也可能没有,因此学生就容易得出
1 条肽链中至少有 1 个氨基和 1 个羧基;那 2 条肽链呢,同样,至少由 2 个氨基和 2
个羧基;m 条肽链至少由 m 个氨基和 m 个羧基。
在讲解的过程中,教师结合板书将以上内容归纳在黑板上,让学生一目了然。
1. 由脱水缩合形成肽链中的数量关系
假设氨基酸的平均相对分子质量为 a,由 n 个氨基酸形成 1 条或 n 条肽链,则有:
形成肽链数 肽键数 脱水数 多肽相对分子质量 游离-NH2 游离-COOH
1 n-1 n-2 an-18(n-1) 至少 1 个 至少 1 个
2 n-2 n-2 an-18(n-2) 至少 2 个 至少 2 个
m n-m n-m an-18(n-m) 至少 m 个 至少 m 个
环状 n n an-18n 不确定 不确定
可见:
①肽键数=脱去的水分子数=氨基酸数−肽链数;
②多肽的相对分子质量=氨基酸的平均相对分子质量×氨基酸的数目−水的相对分子质量×脱
去的水分子数=氨基酸的平均相对分子质量×氨基酸的数目−水的相对分子质量(氨基酸数−肽链
数)
接下来可以讲蛋白质中游离氨基或羧基的计算,通过以上分析我们可以得出蛋
白质中至少含有的氨基数或羧基数=肽链数;同时我们也知道对 1 条肽链而言,游离
的氨基(-NH2 )数=肽链一端的氨基数+R 基上的氨基(结合图 4 )。而 1 条肽链一端
的氨基数目恰好是 1 个,等于肽链数目;同理对于 2 条肽链组成的蛋白质,游离的
氨基(-NH2 )数=2 条肽链一端的氨基数+R 基上的氨基。因此我们可以知道游离的
氨基数或羧基数=肽链数+ R 基上的氨基。接下来归纳一下,让学生
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