R语言之计、绘图与编程-PPT.ppt

* * * * * * * * * * * * * * * * * * 第3章 R 语言对象 * * * * * * * * * * * * * * * 第5章 数组和矩阵 * * * * * * * * * * * * * * * * 1.3 指令的取消和订正 * 1.4 命令的输入与输出 输出 sink() * 1.5 删除数据和对象 * * 第2章 R 语言基本数据结构 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 张金龙 R初步 * 语言 统计、绘图与编程 * 第1章 R 简介--什么是R? 图1 R首页的图形 R是一种统计绘图语言，也指实现该语言的软件。 The R Project for Statistical Computing * 简 史 R语言是从S统计绘图语言演变而来，可看作S的“方言”。 S语言上世纪70年代诞生于贝尔实验室，由Rick Becker, John Chambers, Allan Wilks开发。 基于S语言开发的商业软件Splus，可以方便的编写函数、建立模型，具有良好的扩展性，在国外学术界应用很广。 1995年由新西兰Auckland大学统计系的Robert Gentleman和Ross Ihaka，基于S语言的源代码，编写了一能执行S语言的软件，并将该软件的源代码全部公开，这就是R软件，其命令统称为R语言。 * R的特点 多领域的统计资源 目前在R网站上约有4528个程序包，涵盖了基础统计学、社会学、经济学、生态学、空间分析、系统发育分析、生物信息学等诸多方面。 跨平台 R可在多种操作系统下运行，如Windows、MacOS、多种Linux和UNIX等。 命令行驱动 R即时解释，输入命令，即可获得相应的结果。 * 为什么选择R？ 丰富的资源 涵盖了多种行业数据分析中几乎所有的方法。 良好的扩展性 十分方便得编写函数和程序包，跨平台，可以胜任复杂的数据分析、绘制精美的图形。 完备的帮助系统 每个函数都有统一格式的帮助，运行实例。 GNU软件 免费、软件本身及程序包的源代码公开。 * 生物信息学来说： * * * R与其他统计软件比较 SAS: 速度快，有大量统计分析模块，可扩展性稍差，昂贵。 SPSS: 复杂的用户图形界面，简单易学，但编程十分困难。 Splus: 运行S语言，具有复杂的界面，与R完全兼容，昂贵。 …… * R的缺点 用户需要对命令熟悉 与代码打交道，需要记住常用命令。 占用内存 所有的数据处理在内存中进行，不适于处理超大规模的数据。 运行速度稍慢 即时编译，约相当于C语言的1/20。 相比点击鼠标进行操作，R仍能够大大提高效率。 * 图2 R软件首页 / * CRAN The Comprehensive R Archive Network 简称CRAN，由世界几十个镜像网站组成网络，提供下载安装程序和相 应软件包。各镜像更新频率一般为1-2天 * Windows下载和安装R * * FAQs * * * * 图 4 R登陆界面(Windows版) 路径： 开始所有程序R 3.0.1 菜单栏 快捷按钮 控制台 光标:等待输入 * 图 5 R Gui 的File菜单 * 图 6 R Gui 的Edit菜单 * 图 7 R Gui 的Packages菜单 * 图 8 R Gui 的Help菜单 * 二 R 基本命令及操作 * 赋值和运算 z = rnorm(1000000,4,0.1) median(z) 赋值: “=”可以用“-”代替 x-z-y-w 简单数学运算有:+,-,*,/, ^,%*%,%%(mod) %/%(整数除法)等等 常用的数学函数有:abs , sign , log , log2, log10 , logb, sqrt , exp , sin , cos , tan , acos , asin, atan * 1.1 ls() 1.2 rm() 1.3 data() * 1.4 * 1.1 R语言中获取帮助方法 * * * 1.2 R语言命令及输入格式 张金龙 R初步