SR遗传结构分析.PDF

— ８８— 江苏农业科学　２０１８年第４６卷第１９期 谷　青，赵冬梅，张　岱，等．北方一作区马铃薯早疫病病菌群体ＳＳＲ遗传结构分析［Ｊ］．江苏农业科学，２０１８，４６（１９）：８８－９２． ｄｏｉ：１０．１５８８９／ｊ．ｉｓｓｎ．１００２－１３０２．２０１８．１９．０２３ 北方一作区马铃薯早疫病病菌群体 ＳＳＲ遗传结构分析 谷　青，赵冬梅，张　岱，何佳昱，杨志辉，朱杰华 （河北农业大学植物保护学院，河北保定０７１０００） 　　摘要：为明确北方一作区马铃薯早疫病病菌不同地理群体的遗传结构，利用５对简单重复序列（ｓｉｍｐｌｅｓｅｑｕｅｎｃｅ ｒｅｐｅａｔ，简称ＳＳＲ）引物对河北、黑龙江、辽宁、内蒙古和宁夏５个省（自治区）的７４株马铃薯早疫病病菌进行遗传多样 性分析。共检测出２６个等位基因，４５个基因型，每对引物的等位基因数为３～７个，平均为５．２个。分析结果显示，５ 省（自治区）的早疫病病菌菌株群体之间相似度都很高，处于０．９００６～０．９８８９之间。相较而言，河北群体和辽宁群体 的亲缘关系较近，内蒙古群体和黑龙江群体的亲缘关系较近，宁夏群体单独为１个分支，表明ＳＳＲ基因型与菌株的地 理来源有相关性。研究还发现，在被测的４５个基因型中，仅出现１次的基因型有３７个，占８２．２％，说明群体遗传多样 性高，推测是准性生殖和人类介导的基因流动共同作用的结果。 　　关键词：马铃薯早疫病；茄链格孢；遗传多样性；ＳＳＲ分子标记 　　中图分类号：Ｓ４３５．３２　　文献标志码：Ａ　　文章编号：１００２－１３０２（２０１８）１９－００８８－０４ 　　随着马铃薯成为继水稻、小麦和玉米之后的世界第四大 有高度多态性［８］。此外，ＳＳＲ技术可靠，需要样品量少，且简 粮食作物，中国以占全球总种植面积的２６．３％和全球总产量 单易操作，可产生共显性和物种特异性遗传标记，因而在群体 ［１］ ［９－１０］ 的２２．２％成为全球最大的马铃薯生产国 。但是，由茄链格 结构研究中十分有利 。Ｍｅｎｇ等利用基因组文库开发了 孢（Ａｌｔｅｒｎａｒｉａｓｏｌａｎｉ）引起的马铃薯早疫病一般可对马铃薯主 ７对ＳＳＲ分子标记，对中国的黑龙江省、河南省、云南省和福 ［２］ 产区造成２０％～２５％的损失，严重时可达７０％～８０％ 。马 建省茄链格孢菌群体进行遗传研究，种群遗传分析表明，病菌 铃薯早疫病是一种气传多循环流行性病害，其病菌对环境的 遗传变异率很高，且菌群间无明显地理隔离，推测这可能是隐 ［１１］ 适应能力强。近年来，马铃薯早疫病在我国大多数马铃薯主 藏的有性生殖和人类介导的基因流动共同作用的结果 。 产区频繁发生和流行，严重影响着马铃薯产业的健康发 为明确北方一作区马铃薯早疫病病菌的遗传结构，研究 ［３］ 展 。病原菌的遗传变异和病菌的生存能力与对植物的致 其基因型与地理来源之间的关系，本研究利用笔者所在实验 病能力有关，从而会影响病害的发生与流行，进而对病害防控 室基于全基因组序列开发出的５对具有多态性的茄链格孢基 ［４］ 产生重要影响 ，因此，了解一个区域病原菌的群体结构对 因组微卫星分子标记，对采自河北、黑龙江、内蒙古、辽宁和宁 ［５］ 于可持续防控病害有极为重要的理论基础作用 。 夏５省（自治区）的马铃薯早疫病病菌菌株进行分析，也为探 目前，随机扩增多态性 ＤＮＡ标记 （ｒａｎｄｏｍａｍｐｌｉｆｉｅｄ 讨北方一作区马铃薯早