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常见的生物医学信息学
生物医学信息学 浙江中医药大学信息技术学院 王海舜 课程学习目的和要求 教学目的:通过本课程的学习,掌握医学信息学的基本原理,能用医学信息学的方法和计算机技术开展医学研究。 课程内容: 医学信息学 生物信息学 课程的内容 医学信息学基础 医学信息标准化 临床信息系统 医学信息有序化 医学信息获取 PACS系统及其实现 医学信息的硬件架构和信息安全 临床信息系统 临床路径 无线网络 医学决策支持 生物信息学概论 生物数据库 序列对比和数据库有哪些信誉好的足球投注网站 课程教学目的和要求 教学方法: 理论课 实验课 医院信息化建设见习、调研 讨论课 考核办法 综述、调研报告、实验报告40% 教学参与情况(讨论课、上课参与)10% 考试50% 教材和参考书目 教材:王伟.医学信息学.高等教育出版社,2006,2 参考书目: (荷兰)J.H.Van Bemmel (美国)M.A.Musen 主编 包含飞 郑学侃 主译,医学信息学,上海科技出版社。 傅征等,医院信息系统建设与应用,人民军医出版社,2003,3 金新政等,医院信息系统,科学出版社, 2004.1 黄晓鹂主编,医学信息学教程,中国科学技术出版社 第一章 医学信息学基础 第一节 医学信息 信息的含义 信息存在的普遍性 信息概念的表述 各家学说:归纳为五种主要学说 国家标准(GB/T4894-1985):是事物变化和特征的反映;是事物间相互联系的表征;是事物在特定信息载体上的映射或再现 信息的特征 语法 语义 语用 医学信息学(Medical Informatics)概念: 医学信息是指医学、医疗卫生和公共健康或药学、药物为信息内容和应用领域的各种信息。 传统的医学信息学--侧重文献信息管理、分析研究。 现代医学信息学--计算机技术与IT应用到医药卫生领域。 医学信息的要素: 语义要素 语用要素 医学信息的类型 根据存在方式分类 人体内信息 人体外信息 根据来源分类 系统内部信息 系统外部信息 根据应用领域分类 医学研究信息 临床研究信息 医学市场信息 医学管理信息 第二节 医学信息学相关概念 信息与数据 数据基本单元---符号 信息构成的基础---数据 信息的外在形式---消息 信息与知识 知识的定义P9 知识的分类 知事类知识(know-what) 知因类知识(know-why) 知能类知识( know-how) 知人类知识( know-what) 知识与信息的关系 信息与文献 文献的概念:记录有信息和知识的一切载体。 文献的等级结构。p12 图1-6 一次文献 二次文献 三次文献 文献与信息的关系 P13 图1-7 信息与知识性 记录性 载体实体形态性 第三节 医学信息学研究 20世纪70年代末借用法语单词informatique medicale而来。将先前的医学计算机科学、医学信息科学、计算机医学应用卫生信息学等统一而成。 1978年国际医学信息学会(IMIA)成立。是WHO认可的非政府组织。1974年起每3年一次会议。 医学信息学的定义 医学信息学是以信息学、信息管理和信息技术为依托,研究医学领域中的信息现象和信息规律,用于医学决策和管理的一门交叉学科。 交叉学科 与IT技术密切相关 任务医学信息利用和共享,提高决策 国外医学信息学的发展过程 医学信息学的初期探索(20世纪60年代) MEDLARS的建成为标志 美国大学“生命科学计算机资源” 医学信息学的发展时期(20世纪70-80年代) 大规模医院信息系统 国际医学信息学会成立(IMIA) 医学信息学的深入研究时期(20世纪80年代中期至今) 大型研究项目的开展 从以数据处理的阶段进入知识处理的新阶段,医学人工智能和专家系统的研究为主要标志。 二、我国医学信息学的发展进程 1995年“金卫工程” 建立国家医疗信息骨干网 建立卫生宏观数据库 建立医院HIS 发行“金卫卡” 军队一、二、三号工程 1987年,中国医学信息学会(CMIA)成立。 04年11月,中国卫生信息学会成立 存在的问题:缺乏研究的深度和广度。 医学信息学的研究对象和研究领域 研究对象 对生命信息现象的研究 应用控制论 P15 图1-8 对人类社会活动中医学信息的研究 循证医学P16 图1-9 诊断-治疗循环 1.人类活动的三个阶段:观察、分析、 行动 2.医疗卫生活动:观察、诊断、治疗 观察、分析、行动 诊断-治疗循环 生物信息学(Bioinformatics)概念 美国人类基因组计划实施五年后的总结报告中,对生物信息学作了以下定义: 生物信息学是一门交叉科学,它包含了生物信息的获取、处理、存储、分发、分析和解释等在内的所有方面,它
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