系统生物学-第六讲-表型组学糖组学、脂质组学.pptx

第六讲 其他组学;表型组学（Phenomics）;;表型组学( phenomics) 最早由Steven A．Garan 于1996 年提出。 表型组学( phenomics) 是研究生物体表现型特征的学科。表型组学近年来得到了迅猛发展，其概念也在逐步完善，但尚未形成定论。 ;Gjuvsland、Freimer 和Houle等生物学家认为，表型( Phenotype) 即生物某一特定物理外观或组成，如植物的株高、花色、产量、酶活力、抗逆性等，是基因型和环境共同作用的结果。 生物的表型组为生物体表现型主要信息的集合，包括形态、发育、生化、生理和行为等各种特征，那么研究这些相关内容的学科即为表型组学。;亦有研究者认为表型组学即为研究生物全部物理外观和化学等表型性状( phenome，表型组) 受环境影响其变化规律的学科，是一门在基因组水平上系统研究某一生物或细胞在不同环境条件下所有表型并结合基因( 基因组) 或蛋白( 蛋白组) 的研究来探究表型的本质及它们???间相互关系的学科。 Robert，Varki 和Tasha等将表型组定义为在遗传和环境因素的影响下，生物体组成、行为、生长所有表型的集合。;通过表型组可以更好的认识和利用基因组、转录组、蛋白质组等生物信息，它与基因组、转录组、蛋白质组等各种组学以及生物信息学、统计学一起构建了系统生物学大厦。;表型组学研究的需求;表型组学研究的成熟;植物表型组学研究特点;表型组学研究意义;植物表型组学研究技术;叶片形态测量仪;麦穗形态测量仪;夹角测量仪;茎秆强度测量仪;麦穗数量测量仪;全自动考种仪;PlantScreen植物表型成像分析系统——高通量植物表型组学研究平台;田间作物可视化信息采集系统;高通量植物表型平台;高分辨率多光谱激光三维扫描测量仪;高通量植物叶绿素荧光成像系统;大型植物叶绿素荧光成像系统;多通道植物群体光合气体交换测量系统;糖组学（Glycomics）;糖组学研究意义;糖组学的研究策略;植物凝集素探针;利用植物凝集素亲和柱捕获糖蛋白的过程;功能糖组学研究技术;凝集素-糖相互作用的芯片;杂交糖类/糖蛋白芯片;糖组学的展望;脂质组学(Lipidomics);脂质是一类难溶于水而易溶于非极性溶剂的生物有机分子。 细胞中脂质分子大体可以分为3大类： 非极性脂质(包括胆固醇??胆固醇酯和甘油三酯) 极性脂质(包括磷脂类、鞘脂类和糖脂类) 脂质代谢物(指脂质合成或水解过程中产生的物质，它们中许多是具有生理活性的第二信使物质);脂质组学(Lipidomics);薄层色谱(TLC)法 最早应用于脂质分析的色谱法。 它将脂类用硅胶板上行法展层, 展开后的板上喷脂质显色剂。 各种脂质在TLC板上展开后, 脂质的定量可采用薄层色谱扫描仪计算积分值, 或将脂质的斑点刮下来, 然后测定其含量。 TLC法分为单向和双向2种。;单向TLC能够同时分析几个样品, 但很难将组分完全分开。 双向TLC可将脂类各组分完全分开, 但是它1次只能分析1个样品。 TLC法具有直观、快捷的优点, 能快速分离脂质, 而且价格比较便宜。 脂质经过TLC初步分离后也可以用气相色谱和高效液相色谱做进一步的分析。 ;TLC法需要的样品量大, 测定的灵敏度和分辨率都很低。 TLC板上的斑点在切除过程中极易发生不饱和脂类氧化, 因而破坏了部分脂类结构。;其他方法 高效薄层层析法(high performance thin layer chromatography，HPTLC) GC-MS ESI-MS MALDI-TOF-MS ;脂质组学数据库;脂质组学的发展前景