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巢湖鸭脂肪代谢相关基因SNPs与肉质性状的关联分析-动物遗传育种与繁殖专业论文
摘 要
禽类肉质嫩度和风味与其肌肉肌内脂肪含量密切相关。为研究安徽省地方品 种巢湖鸭肉质生理和遗传特性,本试验以 12 周龄巢湖鸭为研究对象,索氏抽提 法测定巢湖鸭胸、腿肌肌内脂肪含量,PCR-SSCP 分析脂肪沉积相关候选基因 ApoVLDL-Ⅱ、A-FABP、CYP7A1 的遗传变异及其与肉质性状的相关性;同时采 用 RT-PCR 技术检测各基因型间的表达差异,探讨表达量与肉质性状的关系。研 究结果将为地方鸭脂肪性状候选分子标记开发提供参考依据。具体研究结果如 下:
1. 巢湖鸭肉质性状分析
分别测定巢湖鸭胸、腿肌 IMF、PH、嫩度、失水率、胸、腿肌率等肉质性 状指标。公鸭的腿肌 IMF 含量(1.75%±0.85%)与母鸭的(1.81%±0.85%)无显著差异 (P0.05),但公鸭的胸肌 IMF 含量(2.08%±0.69%)显著高于母鸭(1.74%±0.60%)
(P0.05);胸、腿肌的 PH 值在 6.51~6.75 之间,胸、腿肌的失水率在 0.74%~ 0.78%之间,胸肌率和腿肌率在 0.10%~0.14%之间;公鸭的胸、腿肌嫩度分别为
12.41 kg±6.61 kg 和 7.97 kg±8.46 kg,母鸭的胸、腿肌嫩度分别为 12.72 kg±6.06 kg
和 18.10 kg±6.12 kg,但公母鸭之间无显著差异(P0.05)。 2. 巢湖鸭脂肪性状相关候选基因 SNP 位点
基因 ApoVLDL-Ⅱ在 688 位点检测到 A→G 突变,位于内含子 1 区域,群体 分为 MM、MH、HH 型,基因型频率分别为 0.57、0.36、0.07,在 2723、2743 位点检测到 C→T 和 T→C 突变,位于内含子 3 区域,群体分为 CC、CT、TT 型, 基因型频率分为别 0.59、0.34、0.07,此两位点的有效等位基因数为 1.60、1.57, 杂合度分别为 0.38、0.36,多态信息含量分别为 0.30、0.30,属于中度多态,均 处于哈代-温伯格平衡状态(P0.05)。
基因 A-FABP 共检测到 3 个 SNPs,分别为 A321G、T944C、C1054T,均位 于内含子 1,321 位点处产生 3 种基因型,分别命名为 BB、BD、DD 型,基因 型频率分别为 0.55、0.35、0.10,944 和 1054 位点处产生 2 种基因型,分别命名 为 AA、AG 型,基因型频率分别为 0.26、0.74,两位点的有效等位基因数为 1.66、 1.88,杂合度分别为 0.40、0.47,多态信息含量分别为 0.32、0.36,属于中度多 态,该群体在 321 位点偏离哈代—温伯格平衡状态(P0.01),而在 944 和 1054 位点处于哈代-温伯格平衡状态(P0.05)。
基因 CYP7A1 在外显子 1 检测到一处 C203T 突变,产生两种基因型,分别 命名为 EE、EF 型,基因型频率为 0.89、0.11,该位点的有效等位基因数为 1.12, 杂合度为 0.10,多态信息含量为 0.09,属于低度多态,处于哈代-温伯格平衡状
I
态(P0.05)。
3. 巢湖鸭相关候选基因多态与表达量、肉质性状的关联分析
基因 ApoVLDL-Ⅱ各基因型的表达量无显著差异(P0.05),HH 型的胸肌 IMF、腿肌 IMF、胸肌嫩度和腿肌嫩度值均高于 MM 和型和 MH 型,公鸭的胸 肌 IMF 显著高于母鸭(P0.05),公鸭的腿肌嫩度极显著高于母鸭(P0.01);TT 型 的腿肌 IMF 含量极显著高于 CC 型和 CT 型(P0.01),TT 型的胸肌 IMF、胸肌嫩 度和腿肌嫩度值均高于 CC 型和 CT 型,公鸭的胸肌 IMF 含量和腿肌嫩度显著高 于母鸭(P0.05)。
基因 A-FABP 各基因型的表达量无显著差异(P0.05),BB 型和 BD 型的胸肌 嫩度和腿肌嫩度极显著高于 DD 型(P0.01),但 BB 型和 BD 型之间无显著差异 (P0.05);母鸭的胸肌嫩度显著高于公鸭(P0.05)。
各基因型和性别在 CYP7A1 基因的胸肌 IMF、腿肌 IMF、胸肌嫩度、腿肌 嫩度、胸肌率、腿肌率指标以及表达量上无显著差异(P0.05)。
研究结果显示,ApoVLDL-Ⅱ和 A-FABP 基因可作为巢湖鸭肉质性状选育的 候选基因。
关键词:巢湖鸭,ApoVLDL-Ⅱ基因,A-FABP 基因,CYP7A1 基因,肉质性状
II
Abstract
The content of intramuscular fat can affect meat tenderness and flavor on poultry. Chaohu duck was seclete
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