巢湖鸭群体遗传多样性和IMP含量与ADSL基因多态关联研究-养殖专业论文.docx

摘 要 为了探明安徽省地方品种巢湖鸭群体遗传多样性和肉质风味物质 肌苷酸 （inosine monophosphate, IMP）含量，以及影响 IMP 丰度的主效基因多态性，本 试验利用 14 个微卫星标记对巢湖鸭 96 个个体分析了其群体的遗传多样性，采用 高效液相色谱法（high performance liquid chromatography, HPLC）测定了巢湖鸭 胸肌、腿肌 IMP 含量，PCR-SSCP 和测序相结合的方法检测了 IMP 合成过程关 键酶之一的腺苷琥珀酸裂解酶（adenylosuccinate lyase, ADSL）基因多态，并与 12 周龄巢湖鸭胸肌、腿肌肌肉 IMP 含量进行相关分析。结果如下： 1、微卫星标记在巢湖鸭群体中共检测出 48 个等位基因，每个基因座平均 等位基因数为 3.43 个，各个基因的基因频率分布在 0.01～0.97 之间，14 个微卫 星座位的 PIC 值在 0.19～0.95 之间，有效等位基因数在 2～6 个，基因杂合度变 化范围在 0.19～0.95。群体遗传多样性显示巢湖鸭核心群遗传多样性较丰富，可 用于今后巢湖鸭的定向选育。 2、巢湖鸭公鸭胸肌 IMP 含量为 0.44±0.23mg/g，腿肌 IMP 含量为 0.36±0.24 mg/g，母鸭胸肌 IMP 含量为 0.57±0.27 mg/g，腿肌 IMP 含量为 0.36±0.19 mg/g， 公鸭肌肉胸肌的 IMP 含量显著高于腿肌(P0.05)，母鸭肌肉中的胸肌 IMP 含量极 显著高于腿肌(P0.01)，不同性别间胸肌 IMP 含量公母差异极显著(P0.01)，而 腿肌的 IMP 含量公母间差异不显著（P0.05）。 3、扩增 ADSL 基因 17908bp-18066bp 片段，经条带分析和测序检测到 5 种 基因型，分别命名 AA、CC、AB、BC 和 AC 型，基因型频率分别为 0.66、0.17、 0.08、0.02、0.07，等位基因 A、B、C 的频率分别为 0.74、0.05、0.21，该位点 基因杂合度为 0.41，且在该位点处于中度多态（PIC 值为 0.41），卡方检验结果 显示该位点基因型的分布处于 Hardy-Weinberg 平衡状态（χ2=1.33，P0.05）。 测序结果显示 AB 型与其他四种基因型相比较在 17948bp 处发生碱基 T 的插入， CC 型与其他四种基因型相比在 17953bp 处发生碱基 C 的插入以及存在 C18001T、 T18003C、G18010C 三个点突变，BC 型与其他四种基因型相比较存在 T17965C 的点突变，AA、CC 与其他三种基因型相比较在 18091bp 处存在碱基 C 的缺失。 4、扩增 ADSL 基因 18158bp-18384bp 片段，经条带分析和测序共检测到 3 种基因型，分别命名为 DF、EE 和 FF 型，基因型频率分别为 0.05、0.85 和 0.10， 等位基因 D、E、F 频率分别为 0.03、0.85、0.12，该位点基因杂合度为 0.26，且 在该位点处于低度多态（PIC 值为 0.23），卡方检验结果显示该位点基因型的分 布偏离了 Hardy-Weinberg 平衡状态（χ2=13.22，P0.01）。测序结果显示 DF 型 与 NCBI 中现已公布的绿头鸭的 ADSL 基因序列（NW-004678857）完全一致， I 将其定义为野生型，其他两种基因型与野生型相比较在 18216bp 处存在碱基 A 的丢失，EE 型与野生型相比较存在 G18225A 的点突变以及在 18259bp 处存在片 段 TTTATTGCCTTTC 共 13 个碱基的丢失。 5、ADSL 基因上多态位点产生的八种基因型与巢湖鸭胸、腿肌 IMP 含量无 显著相关性（P0.05）。合并基因型与巢湖鸭胸、腿肌 IMP 含量分析发现，AAFF 与 CCFF、CCDF 与 CCFF、AAEE 与 ACEE 以及 CCFF 与 ACEE 间 IMP 含量显 著相关（P0.05）。 因此，巢湖鸭群体的遗传多样性较丰富；巢湖鸭公鸭肌肉IMP含量胸肌显著 高于腿肌，母鸭肌肉中IMP含量胸肌极显著高于腿肌，公母之间胸肌的IMP含量 公母差异极显著，而腿肌的IMP含量公母间差异不显著。巢湖鸭ADSL基因11内 含子上存在片段丢失、碱基插入、缺失和点突变四种类型突变。多位点突变使巢 湖鸭胸、腿肌IMP含量差异显著。 关键词：巢湖鸭，微卫星，遗传多样性，IMP，ADSL 基因 II Abstract In order to find the local varieties of Anhui province chaohu ducks’ p