《肽的结构和功能(三)》课件.ppt

多肽链：通过可旋转的Cα连接的酰胺平面链 这种旋转是受到限制的 多肽链中AA残基按一定顺序排列：氨基酸顺序 含游离?-氨基的一端：氨基端或N-端 含游离?-羧基的一端：羧基端或C-端 AA顺序是从N-端开始以C-端氨基酸残基为终点 如上述五肽：Ser-Val-Tyr-Asp-Gln 1、?肽的酸碱性质 短肽在晶体和水溶液中是以偶极离子形式存在。 肽的酸碱性质取决于Ｎ端α－ＮＨ２和Ｃ端α－COOH以及侧链Ｒ上可解离的基团。 在长肽或蛋白质中，可解离的基团主要是侧链基团。 二、蛋白质的空间结构 1、定义 蛋白质分子中所有原子在三维空间的分布和肽链的走向 方法：X射线衍射法，核磁共振法 2、空间结构中的作用力 次级键（氢键、盐键）、疏水作用、范德华力 氢键：一个电负性原子上共价连接的氢，与另一个电负性原子间的静电作用力。 盐键：不同电荷间的相互作用力 疏水作用：氨基酸疏水侧链相互聚集形成的作用力 位于蛋白质内部的AA侧链全为疏水的。 范德华力：由瞬间偶极诱导的静电相互作用形成的 a盐键（离子键 ） b氢键 c疏水相互作用力 d 范德华力 e二硫键 二、蛋白质的二级结构 蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构，即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置，并不涉及氨基酸残基侧链的构象 。 1、定义 2、主要的化学键： 氢键 （稳定因素） 蛋白质二级结构的主要形式 ?-螺旋 ( ? -helix ) ?-折叠 ( ?-pleated sheet ) ?-转角 ( ?-turn ) 无规卷曲 ( random coil ) （一） ?-螺旋（最常见的结构） ?-螺旋结构要点: ①多肽链主链围绕中心轴形成右手螺旋，侧链伸向螺旋外侧。 ②每圈螺旋含3.6个氨基酸，螺距为0.54nm。 ③每个肽键的亚氨氢和第四个肽键的羰基氧形成的氢键保持螺旋稳定。氢键与螺旋长轴基本平行。 ④α-螺旋有左手螺旋和右手螺旋两种，天然蛋白质的α-螺旋绝大多数都是右手螺旋，仅在嗜热菌蛋白酶的晶体结构中发现左手螺旋。右手螺旋较稳定。 氨基酸侧链所带电荷 、大小及形状。 影响α-螺旋形成的因素： 多肽链中有Pro（或羟脯氨酸）时螺旋中断 多肽键中存在大量Gly、Ser、Thr也不利于形成α-螺旋 第三节 肽 (peptide) 肽键(peptide bond)：是由一个氨基酸的?-羧基与另一个氨基酸的?-氨基脱水缩合而形成的化学键。 一、肽键 1. 定义 氨基酸残基 氨基酸残基 二、肽单元 (peptide unit) 参与组成肽键的6个原子位于同一平面，又叫酰胺平面或肽键平面。它是蛋白质构象的基本结构单位。 1. 定义 H H H H φ 和ψ= 0°时的主链构象 2. 肽平面的性质 肽平面键长和键角一定 肽键有40%的双键性质，相关的6个原子 处在同一平面 （肽平面、酰胺平面） 肽键的原子排列呈反式构型 相邻的肽平面构成两面角 三 、 肽的命名 1）以氨基酸残基的数量命名 2-12个：二肽、三肽、四肽…… 12-20个: 寡肽 20个：多肽 2）以氨基酸残基的名称命名 从N端开始，连续读出氨基酸残基的名称，并将“酸”改为“酰”。 举例：丝氨酰甘氨酰酪氨酰丙氨酰亮氨酸 四、肽的书写 NH2末端（N端）放在左边，COOH末端（C端）放在右边，用连字符将氨基酸从N端到C端连接起来 举例： Ser-Gly-Tyr-Ala-Leu S-G-Y-A-L 1) 已知氨基酸序列 2）未知氨基酸序列 将氨基酸及数量写在括号内，并以逗号间隔 举例： （Ala, Cys2, Gly) N 末端：多肽链中有自由氨基的一端 C 末端：多肽链中有自由羧基的一端 多肽链有两端 * 多肽链(polypeptide chain)是指许多氨基酸之间以肽键连接而成的一种结构。 N末端 C末端 牛核糖核酸酶 五、肽的重要性质 2、 旋光性 一般短肽的旋光度等于其各个氨基酸的旋光度的总和。 肽末端α-羧基pKa值比游离AA中的大。 肽末端α-氨基pKa值比游离AA中的小。 3、 解离系数 六、生物活性肽（BAP） 定义 调节生物体的生命活动或具有某些生理活性的寡肽和多肽的总称 2.作用： 调节酶类，保障代谢，影响蛋白质合成 1）谷胱甘肽(glutathione, GSH) 结构: 3.常见生物活性肽 GSH过氧化物酶 H2O2 2GSH 2H2O GSSG GSH还原酶 NADPH+H+ NADP+ GSH的转化: GSH是细胞内十分重要的还原剂 －SH