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《生物化学教学课件第四章(一) 生化protein i new
异常功能蛋白——应乐果甜蛋白有极高的甜度,可做人工增甜剂; 昆虫翅膀的结合部的节肢弹性蛋白,有特殊的弹性; 支架蛋白——通过蛋白-蛋白相互作用识别并结合其它蛋白中的某些结构元件,将多种不同的蛋白质装配成一个复合体,参与对激素和其它信号分子胞内应答协调和通信。 谷氨酰胺和天冬酰胺有酰胺基,与茚三酮反应产生棕色化合物。 而脯氨酸与羟脯氨酸含α-亚氨基,与茚三酮反应形成黄色的产物,在440nm有最大吸收,可定量测定。反应中无氨的释放。 氨和胺类也与茚三酮反应,但不放出二氧化碳。 (2) (与)亚硝酸反应 这也是α-氨基所特有的反应。 氨基酸与亚硝酸反应放出氮气,其中的一个氮原子来自氨基酸,另一个则来自亚硝酸。 该反应是Van Slyke氏氨基测定的理论基础。 此反应可用来判断蛋白质的水解程度,蛋白质水解愈完全,放出的α-氨基酸愈多,与亚硝酸反应放出的氮愈多。 脯氨酸含α-亚氨基,故无此反应。 (3)与2,4-二硝基氟苯反应 在弱碱性(pH 8-9)、暗处、室温或40 ℃条件下,氨基酸和2,4-二硝基氟苯反应生成黄色的二硝基苯氨基酸(dinitrophenylamino acid,简称DNP-氨基酸)。 该反应由F.Sanger首先发现,并用于鉴定多肽或蛋白质的N-端氨基酸。此即Sanger反应。 除α-氨基外,酚羟基、ε-氨基、咪唑基也有反应,但其反应的产物在酸性条件下,不溶于乙醚、乙酸乙酯,而留在水相中。 (4)与苯异硫氰酸(PITC)的反应 在弱碱性条件下,氨基酸与苯异硫氰酸反应生成苯氨基硫甲酰氨基酸(PTC-氨基酸)。 在酸性条件下,生成的PTC-氨基酸环化而转变为苯乙内酰硫脲氨基酸,简称PTH-氨基酸。 瑞典科学家Edman首先使用该反应测定蛋白质N-末端的氨基酸。 此即Edman反应。 a-氨基和羧基参与及其它的反应(参考) 第三节 蛋白质的结构 自然界存在的蛋白质大约有1010-1012种,不同的蛋白质具有不同的结构。 那么,由20种氨基酸如何组成了数目繁多、结构各异的蛋白质大分子? 20世纪50年代初,Linder-Strop-Long及其同事最先认识到蛋白质具有不同的结构层次,并引入一级、二级、三级结构来描述这一现象。 这是蛋白质分子在结构上的一个最显著的特征。 这种划分尽管有一定的缺点,但它反映了蛋白质分子结构的多层次和错综复杂的基本特点。 这种划分概念清楚,使用也方便。 60年代以后,随着对蛋白质分子结构知识的积累,又增加了不少新的内容。 如在三级结构以上又增加了四级结构,在二级和三级结构之间又增加了超二级结构和结构域这两个结构层次。 一. 蛋白质的一级结构 蛋白质的一级结构(primary structure): 多肽链内氨基酸残基从N-末端到C-末端的排列顺序及二硫键的位置,也称氨基酸的序列、排列顺序,是蛋白质最基本的结构。 (一) 肽键和肽链的结构 肽键(peptide bond)是蛋白质中氨基酸之间的主要连接方式,即一个氨基酸 的α-羧基与另一个氨基酸的α-氨基之间 脱去一分子水相互连接(酰胺键)。 参与形成肽键后,氨基酸即变为氨基酸残基。 此外,侧链基团参与形成的酰胺键称 为异肽键。 共价主链:由肽单位规则地重复排列而成。 (二) 肽的命名及结构 最简单的肽由两个氨基酸通过一个肽键连接而成,称为二肽;依次称为三肽、四肽、五肽等。 寡肽: 少于10个氨基酸。 多肽: 多于 10个氨基酸。 蛋白质与多肽并无严格的界线,通常是将分子量在6000(也有说5000)道尔顿以上的多肽称为蛋白质。 肽的命名一般根据其功能和来源进行 如脑啡肽(enkephalin,EK),1975年,Hughes and kosterlitz发现猪脑内有内源性吗啡样活性物质,并从脑抽提液中分离纯化出两种脑啡肽,它们均由5个氨基酸组成。 现已证明,高等动物脑中有两种形式的脑啡肽: 蛋氨酸脑啡肽,
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