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真题答题(大题须稍加整理)
DNA的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。双链DNA在多种酶的作用下可以变性解链成单链,在HYPERLINK /search?word=DNA%BE%DB%BA%CF%C3%B8fr=qb_search_expie=utf8DNA聚合酶与启动子的参与下,根据HYPERLINK /search?word=%BC%EE%BB%F9fr=qb_search_expie=utf8碱基互补配对原则复制成同样的两分子挎贝。在 HYPERLINK /search?word=%BE%DB%BA%CF%C3%B8%C1%B4%CA%BD%B7%B4%D3%A6fr=qb_search_expie=utf8聚合酶链式反应实验中发现,DNA在高温时也可以发生变性解链,当温度降低后又可以复性成为双链。因此,通过温度变化控制DNA的变性和复性,并设计引物做启动子,加入HYPERLINK /search?word=DNA%BE%DB%BA%CF%C3%B8fr=qb_search_expie=utf8DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的体外复制。
PCR利用了DNA的热变性原理,通过控制温度来控制双链的解聚与结合,现在使用的PCR仪实质上也是一台能够自动调控温度的仪器。
PCR一般经历三十多次循环,每次循环可以分为三个基本步骤──变性、复性和延伸。
(!)变性(模板DNA解旋)
模板DNA经加热至90℃以上。一定时间后,使模板DNA双链解离,使成为单链,以便于它与引物结合,为下轮反应作准备。
(2)复性(退火)
模板DNA经加热变性成单链后,温度降到50℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合。
(3)延伸
DNA模板-引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下以脱氧核苷酸为原料,以母链为模板,按碱基互补配对的原则与半保留复制的原理,合成一条新的DNA链。
循环数
变性
复性
延伸
第一次(预变性)
94°C,30s
-
-
30次
94℃,20s
52℃,20s
72℃,20s
最后一次(保温)
72℃,30s
(2)琼脂糖凝胶电泳
DNA在电厂作用下,可以由电源的负极向正极泳动,泳动的速度与DNA片段的长度成负相关,与电压强度成正比,因此可以分离不同长度的DNA。在有DNA marker(不同已知碱基对大小的DNA片段的混合物)的条件下,由于不同碱基大小的DNA片段在琼脂糖凝胶上涌动的速度不同,因此电泳完毕后会出现在胶块的不同位置。通过将扩增出的DNA片段与已知的条带做比较,可以大概推测出该片段的碱基对的大小。如果要进一步检测其大小,可以换另外规格的DNA marker 继续电泳。核酸荧光染料可以与DNA嵌合,一起电泳,DNA图谱观察仪可以激发特定的蓝色光源,荧光染料在该光照射下可见到荧光,荧光的亮度与DNA大小成正比。
三、实验仪器及试剂
7种PCR组分 微量可调移液器 离心管 PCR仪 水平电泳槽 电泳仪电源 紫外分光光度计 250ml锥形瓶(封口膜) 记号笔 卫生纸
四、实验步骤
1、DNA体外扩增
(1) 将所有试剂管瞬时离心一次(4000r/min,1min),使管壁没有残留药品,在引物 = 1 \* ROMAN I 和引物 = 2 \* ROMAN II的离心管内用移液器各加入40ul双蒸水(ddH2O),混匀后瞬时离心一次。所有的离心管都摆到双面板上。
(2)向装有Taq DNA 聚合酶的离心管按下表加入以下成分:
10x Buffer
50 μL
MgCl2
50 μL
dNTP mixture
20μL
上游引物(引物 = 1 \* ROMAN I)
25μL
下游引物(引物 = 2 \* ROMAN II)
25 μL
模板DNA
25 μL
ddH2O
290μL
原有的Taq DNA 聚合酶有15ul,此时混合液体系共计500ul,此步骤由第一、二组同学合作完成。(在实验老师的监督指导下操作,确保此后其他同学的实验顺利进行)
(3)共分25组,第一、二组的同学并入其他小组进行实验。每组取20ul的上述混合液于0.5ml的离心管中,加入15ul的液体石蜡封闭体系,以防止在加热过程中蒸发。
(4) 对自己组的离心管上进行标记之后,放到PCR仪上进行DNA扩增。
2、琼脂糖凝胶电泳检测DNA
(1)用蒸馏水将电泳槽和梳子冲洗干净,放在水平桌面上,并架好梳子。
(2)配制浓度为1%(1 g/100 mL)的琼脂糖凝胶2块。在锥形瓶中,称取1g的琼脂糖粉,加入100ml 1x电泳缓冲液,用封口膜封住瓶口后在微波炉内加热,使琼脂糖粉熔化,然后冷却至60 ℃,倒入电泳槽中(每块胶50ml),插好梳子,待其凝固。(电泳槽首先用透明胶带将两端封住再进行倒胶)
(3)待胶凝固后,去掉胶带纸,小心移去梳子,注意不要破坏加样孔。将倒胶槽至
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