基于SSR的中华鲟亲子鉴定和遗传特性研究-水生生物学专业论文.docxVIP

理学硕士学位论文基于SSR的中华鲟亲子鉴定和遗传特性研究 理学硕士学位论文 基于SSR的中华鲟亲子鉴定和遗传特性研究 研究生：辛苗苗 导 师：危起伟研究员 指导老师：张书环助理研究员 公益性行业(农业)科研专项：珍稀水生动物繁育与物种保护技术 研究(201203086)资助 西南大学生命科学学院 中国·重庆 201 5年5月 万方数据 1愀幽MASTER 1愀幽 MASTER DISSERTATIoN Genetic characteristics and parentage identification of Chinese sturgeon(A cipenser sinensis)basedeElsls base on0n S SR Candidate：Xin Miaomiao Supervisor：Pro￡Wei Qiwei Adviser：Assistent Research Pro￡Zhang Shuhuan Supported by Special Fund for Agro—Scientific Research in the Public Interest(20 1 203086) School of Life Science，Southwest University Chongqing，China June，2015 万方数据 独创性声明学位论文题目： 独创性声明 学位论文题目： 基王SS＆的主堡鱼要塞壬鉴定塑逮笾缝性塑窥 本人提交的学位论文是在导师指导下进行的研究工作及取得的研 究成果。论文中引用他人已经发表或出版过的研究成果，文中已加了 特别标注。对本研究及学位论文撰写曾做出贡献的老师、朋友、同仁 在文中作了明确说明并表示衷心感谢。 学位论文作者： 本扬彩 签字曰期：阳箩年夕月．z日 学位论文版权使用授权书 本学位论文作者完全了解西南大学有关保留、使用学位论文的规 定，有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘，允 许论文被查阅和借阅。本人授权西南大学研究生院(筹)可以将学位 论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩 印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。 (必威体育官网网址的学位论文在解密后适用本授权书，本论文：口不必威体育官网网址， 口必威体育官网网址期限至 年 月止) 学位论文作者签名：辛面彩 导师签名：彳 万方数据 目 目 录 摘 要 ．．I Abstract．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．． ．．．．．．．．．．．．．．．．．． ．．．．．．．．．．．．．．． ．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．III 第l章文献综述 ．1 1．1分子标记 ．1 1．1．1分子标记的类型 l 1．1．2 DNA分子标记的特点 2 1．1-3微卫星标记 4 1．2亲子鉴定 ．7 1．2．1亲子鉴定的定义及原理 7 1．2．2基于SSR的常用亲子鉴定判定方法 一7 1．2．3亲子鉴定在水生生物中的应用 8 1．3种群遗传多样性研究 ．9 1．3．1种群遗传多样性定义 9 1．3．2微卫星标记在水生生物种群遗传多样性中的应用 ．10 1．4中华鲟的研究概况 ll 1．4．1中华鲟的简介 ．1l 1．4．2中华鲟资源现状 ．12 1．4．3中华鲟多倍体研究 ．13 1．4．4中华鲟分子生物学研究 ．1 3 1．4．5中华鲟其他方面研究 ．15 1．5本研究的目的意义及技术路线 15 第2章中华鲟多态微卫星引物的筛选 ．17 2．1前言 ．17 2．2材料与方法 1 7 2．2．1实验材料 ．1 7 2．2．2主要仪器 ．1 7 2-2．3主要试剂 ．1 8 2．2．4基因组DNA的提取 l 8 2．2．5基因组DNA的检测 19 2．2．6微卫星序列选取及引物的设计 ．19 2．2．7 PCR扩增 20 2．2．8聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)检测 2l 2．2．8．112％PAGE凝胶配方 ．21 2．2．8．2 PAGE凝胶试剂配方 ．2 l 2．2．8．3 PAGE凝胶检测 ．2 l 2．2．9银染法 一22 2．2．1 O数据分析 23 2．3结果 ．23 2．3．1中华鲟基因组DNA的提取 23 万方数据 2．3．2微卫星引物的设计 2．3．2微卫星引物的设计 ．24 2．3．3多态微卫星引物筛选及微卫星标记特征 ．24 2．4讨论 ．29 2．4l微卫星位点多态性 ．29 2．4．2哈迪一温伯格平衡检验 29 2．4．3多倍体中华鲟 ．30 第3章多倍体中华鲟微卫星亲子鉴定体系的建立 3 1 3．1前言 31 3．2材料和方法 31 3．2．1实验材料 ．3 l 3．2．2实验仪器 ．32 3．