荷斯坦牛乳房炎相关基因多态性及其与体细胞评分的相关性分析-动物遗传育种与繁殖专业论文.docxVIP

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2018-12-19 发布于上海
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荷斯坦牛乳房炎相关基因多态性及其与体细胞评分的相关性分析-动物遗传育种与繁殖专业论文.docx

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荷斯坦牛乳房炎相关基因多态性及其与体细胞评分的相关性分析-动物遗传育种与繁殖专业论文

著低于 AA 基因型均值（P0.0001）；AB 基因型的 SCS 最小二乘均值极显著低于 AA 基因型均值（P0.01）。G1793A 突变位点经 BsiYⅠ酶切产生两种基因型 CC 和 CD，其频率分别为 0.332 和 0.668；C1859A 突变位点经 BstXⅠ酶切产生两种基因型 EE 和 EF，其频率分别为 0.178 和 0.822；G1934A 突变位点经 BsiYⅠ酶切产生 2 种基因型 GG 和 GH，其频率分别为 0.356 和 0.644；A1980G 突变位点经 BclⅠ酶切产生 3 种基因型 II、IJ 和 JJ，其频率分别为 0.260、0.567 和 0.173。χ2 检验显示仅 A1980G 位点处于 Hardy-Weinberg 平衡；关联分析表明，JJ 基因型的 SCS 最小二乘均值极显著低于 IJ 基因型均值（P0.01），极显著低于 II 基因型均值（P0.0001）；IJ 基因型的 SCS 最小二乘均值极显著低于 II 基因型均值（P0.01）。本研究结果初步表明 TLR6 基因 B 和 J 等位基因是提高奶牛乳房炎抗性的两个潜在 DNA 标记。关键词：荷斯坦牛，体细胞评分，BoLA-DRB3 基因，TLR 基因，乳房炎，SNP Abstract The single nucleotide polymorphisms (SNPs) in BoLA-DRB3 gene，TLR1 gene and TLR6 gene were detected and their association with mastitis was analyzed in Holstein cows. 489 Holstein cows and 40 Holstein bulls were sampled from 4 dairy farms of Hebei Province. The polymorphism in exon 2 of BoLA-DRB3 gene (BD3-2) was tested using PCR-RFLP with restriction endonuclease BstYⅠ,the SNPs of TLR1 gene and TLR6 gene using PCR-SSCP. The correlation among somatic cell score of cows (SCS) and different genotypes was analyzed using least-squares analysis, the results as follows： Three genotypes (AA, AB and BB) were detected in BD3-2 of Holstein cows, and the frequencies of three genotypes were 0.078, 0.380 and 0.542, respectively.AB and BB genotypes were found in Holstein bulls, and the genotypic frequencies were 0.250 and 0.750, respectively. The Chi-square test showed that the three loci in Holstein cows and bulls were in Hardy-Weinberg equilibrium (cows: χ2 =0.45, p=0.799; bulls: χ2 =0.82, p=0.665).and Least squares mean (LSM) of SCS for AA genotype was significantly lower than that for AB (p=0.0098) or BB (p=0.00009).LSM of SCS for AB genotype was significantly lower than that for BB (p=0.0096). AA was the most favorable genotype, and BB was the most unfavorable genotype for mastitis resistance. Four polymorphic sites at G1409A, A1475C, G1550A and G1596A were found in the mRNA sequence of TLR1 gene in Holstein cows in which G1