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三种蓑藓属植物的形态变异与遗传结构研究-命植物学专业毕业论文
摘要 上海师范大学硕士学位论文
种在叶片上部长宽比的变异系数最大、差异最小的是叶长。基于13个形态性状, 应用聚类分析可以将40份样本分成三组。筛选出了13条重复性好的ISSR引物, 在6个中华蓑藓地理居群中共扩增出135条带,其中128条具多态性,多态性 条带百分率为94.8l%。居群总的Nei指数为0.3186,居群内的基因多样性占 65.44%。基于128个位点,将40份样本聚成3组。在研究区域内,中华蓑藓的 形态变异与遗传背景之间(r=0.14,n=40,P0.2)的相关性不明显,而地理来 源对遗传分化(r=0.213,11=40,P0.1)和形态变异(r=0.224,11=40,P0.1) 有一定的影响。
(4)共测定了7个地理居群46份钝叶蓑藓样本的7个形态性状,发现该种 形态变异最强烈的是叶片上部长宽比,区别作用最小的是叶长变化。基于7个形 态性状数据,应用聚类分析可以将46份样本分成四组。利用筛选出的13条ISSR 引物,基于7个地理居群的钝叶蓑藓共扩增出192条带,多态性条带为188条, 多态性条带百分率为97.92%;居群总的Nei指数为0.2467,居群内的基因多样 性占61.25%。基于188个位点,将40份样本聚成4组,钝叶蓑藓的形态变异与 遗传背景之间(r=0.204,n=46,P0.2)、形态性状与地理来源之间(r=0.209,n
=46,P0.2)存在一定的相关性,而在遗传与地理来源之间没有相关性(r=-
O.025,11=40,p O.5)。
(5)以192份样本为对象,以13个形态性状和从13个ISSR引物中扩增 出来的249个位点信息为指标,应用聚类分析、基于除趋势对应分析的模糊均值 聚类,获得了展示缺齿蓑藓、中华蓑藓和钝叶蓑藓在形态和遗传差异的聚类图和 二维排序图。基于形态和分子数据的系统聚类图上,192份样本均可以分成三组, 两者也有很好的对应性,在形态聚类图上仅有6份样本在中华蓑藓和缺齿蓑藓两 个种的归属上有误。在基于叶片性状的形态聚类图上,中华蓑藓与缺齿蓑藓更相 近,而在基于遗传数据的聚类图上,中华蓑藓与钝叶蓑藓更相近,这与传统地将 这两者归于平蒴组,而缺齿蓑藓属于棱蒴组相一致。
(6)本文采用了模糊均值聚类法开展了基于形态和遗传数据的分类,通过 分组的平均Silhouette宽度值和各样本的成员值,很好地反映了不同样本隶属该 组的合理程度。
关键词:形态、主成分分析、遗传多样性、蓑藓、ISSR、模糊均值聚类
Ⅱ
万方数据
SUBJECT:Research on morphological variations and genetic structure of three
Macromitrium species MAJOR:Botany AUTHOR:Liu Xiaohui
SUPERVISOR:Prof.Guo Shuiliang
Macromitrium cavaleirei CardotThdr.,M gymnostomum Sull.Lesq.and Macromitrium japonicum DozyMolk.are three widely spread species in eastern China.In order to understand their morphological and genetic variations and their relationships with geographical background,thus to know the characteristics of their intraspecific variation and diversity,we collected 192 samples ofthese three species from 24 geographical locations in Zhejiang,Guangxi,Fujian and Taiwan provinces, and determined their leaf and cytological traits.After our establishing the optimized
systems of ISSR-PCR for plant materials of Macromitrium by using orthogonal design,we also obtained their ISSR data.Finally,we analyzed the characteristics of
their morphological and genetic variations and genetic divers
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