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常见血液肿瘤FISH检测小册
一.FISH是什么
FISH即荧光原位杂交技术(Fluorescence in situ hybridization),是在细胞遗传学水平上检测染色体及基因数目和结构异常的一种分子病理检测技术。其基本原理是利用标记了荧光素的核酸作为探针,按照碱基互补原则,与待检样本中与之互补的核酸经过变性-退火而形成杂交双链核酸,然后通过荧光显微镜进行检测和分析。
FISH技术具有直观、快速、敏感性高和方便灵活等特点,目前已经广泛应用于临床的肿瘤遗传学及各种基因相关疾病的分型与个体化治疗等多个领域。
二.血液肿瘤的诊断分型
MICM:血液肿瘤诊断的精确分型是临床选择正确治疗方案的前提,目前国际上通用的是结合细胞形态学(Morphology)、免疫学(Immunology)、细胞遗传学(Cytogenetics)和分子生物学(Molecular)的MICM分型。
形态学诊断(Morphology)
细胞学:外周血、骨髓涂片,淋巴结穿刺组织学:骨髓、淋巴结活检
免疫学检查(Immunology)
免疫组化(IHC),流式细胞(FCM)
细胞遗传学检查(Cytogenetics)
核型分析,荧光原位杂交(FISH)
分子生物学检查(Molecular)
PCR,DNA测序
三.FISH技术的作用及优势
FISH作为一项很重要的分子遗传学检测技术,在血液肿瘤的诊断中有很大的作用,得到了NCCN等国内外各大血液肿瘤诊疗指南的认可和建议。
目前与血液肿瘤相关的FISH探针有接近100种,常用的就有60种左右,包括急慢性白血病、骨髓增生异常综合症(MDS)、多发性骨髓瘤(MM)、淋巴瘤等多种血液肿瘤。
FISH技术的相对优势:
FISH技术更敏感,可检测出核型分析检测不出的细微缺失或易位,如MDS中的5q缺失综合征;
FISH技术不需要中期分裂相细胞,而核型分析需要培养时间较长且需要较高的操作要求;
FISH技术是在细胞形态的基础上进行结果判读,可有效地降低假阴性或假阳性的风险,而PCR技术经过倍增扩增,不能在形态的基础上判读,对实验要求高,易产生假阴性或假阳性。
四.常用的血液FISH检测探针
1急性粒细胞白血病(AML):样本建议骨髓AML1/ETO融合基因(M2b分型)PML/RARA融合基因(M3分型)CBFB基因断裂(M4分型)KMT2A(MLL)基因断裂(预后差,治疗失败风险高)其他:□8号染色体、□CBFB/MYH11基因融合、□RARA基因断裂、□5q缺失、□7q缺失、□EVI基因断裂2慢性粒细胞白血病(CML):样本优先骨髓BCR/ABL(DF)融合基因检测(指导格列卫用药)嗜酸性粒细胞增多症(格列卫作用靶标):□PDGFRA基因断裂、□PDGFRB基因断裂、□FGFR1基因断裂其他:□BCR/ABL(ES)、□BCR/ABL(SF)、□i(17q)、□ASS基因缺失3急性淋巴细胞白血病(ALL):样本建议骨髓ETV6(TEL)/AML1融合基因(预后较好,但易复发)TCF3(E2A)基因断裂(标准化疗后易早期复发)BCR/ABL融合基因(易迅速复发,对挽救性化疗反应不佳)儿童急性淋巴细胞白血病染色体及基因异常(4、10、17、TEL/AML1、KMT2A基因断裂、BCR/ABL(DF),预后评估及治疗方案的选择)其他:□ TCF3(E2A)/PBX1、□4、10、17;□MYC基因断裂、□IGH基因断裂、□KMT2A基因断裂、□CDKN2A(P16)基因缺失4慢性淋巴细胞白血病(CLL):样本优先外周血或骨髓慢性淋巴细胞白血病染色体及基因异常(P53、RB1(13q14)、ATM(11q22)、D13S25(13q14)、12,预后评估及治疗方案的选择)其他:□DLEU1(13q14)、□P53、□ATM(11q22)、□MYC基因扩增、□6q、□TERC、□GLI、□12、□BCL2/IGH、□CCND3/IGH5骨髓增生异常综合症(MDS):样本建议骨髓骨髓增生异常综合症染色体及基因异常(5q、7q、20q、8、X/Y,预后评估及治疗方案的选择)其他:□5q、□7q、□20q、□EGR1、□EVI1基因断裂、□X/Y6多发性骨髓瘤(MM):样本建议骨髓多发性骨髓瘤染色体及基因异常(P53、1q21、RB1(13q14)、D13S319(13q14)、IGH,预后评估及治疗方案的选择)其他:□CCND1(BCL1)/IGH、□MAF/IGH、□FGFR3/IGH、□MAFB/IGH、□CCND3/IGH、□11q23及DLEU1、□P53、□15q22及6q2
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