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尽管PCR扩增DNA非常有效,但目的DNA序列的指数扩增并不是一个无限制的过程。 在正常的反应条件下,经30次循环之后,酶的催化反应趋于饱和,就会出现平台效应 (Plateau) ,产物的量不再增加。 “平台效应”出现的迟早还取决于酶的性能、模板DNA的拷贝数、dNTP浓度等多种因素。 RT—PCR 以mRNA为原始模板的PCR,亦称逆转录PCR。 逆转录反应在42 ℃进行,随后将反应混合物加热至95 ℃5min,灭活逆转录酶,取2ul反应产物,按DNA为模板的PCR反应步骤,进行扩增反应。 三、PCR在医学中的应用 对人类遗传信息的认识和研究 基因工程药物与疫苗生产 转基因动物和植物制造 基因诊断与基因治疗 镰刀型红细胞贫血 Chehab等设计一对引物把含有突变的DNA片段(共294bp)扩增,扩增产物用限制性内切酶 OxaN I消化,琼脂糖凝胶电泳后染色观察: 正常人有2个片段,191 和 103bp, 镰刀状红细胞贫血的 纯合子,仅有一个片段294bp 杂合子有191、103和294bp 3个片段 综合了分子生物学、微电子学、微加工和计算机等学科知识 本质:在固定的玻片等载体上的微型生物化学分析系统,芯片上每平方厘米可排列成千上万生物分子,能快速准确地检测核酸,并获取样品中的有关信息。 第四节 DNA芯片技术 分子生物学常用技术及其应用 第一节 基因工程 一基因工程的基本概念 DNA重组——不同来源的DNA分子通过末端共价连接而形成重新组合的DNA分子的过程。 基因工程——采用人工方法将不同来源的DNA进行重组,并将重组后的DNA引入宿主细胞中进行增殖或表达的过程。 生物技术——包括基因工程、蛋白质工程、酶工程、、细胞工程。 克隆——通过无性繁殖所产生的与亲代完全相同的子代群体。 二、工具酶 限制性核酸内切酶:能从中间有选择性地切割DNA分子特异序列。 DNA连接酶 DNA聚合酶 逆转录酶多核苷酸激酶 碱性磷酸酶 末端脱氧核苷酸转移酶 三、载体 载体必须符合以下几点要求: (1)能在宿主细胞内复制并具有较高的拷贝数 (2)容易进入宿主细胞 (3)具有多个限制性核酸内切酶单一的酶切位点 (4)容易从宿主细胞中分离纯化 (5)有容易被识别筛选的标志 常用的载体包括:质粒、λ噬菌体、粘粒、病毒 由质粒与λ噬菌体构成 四、重组DNA技术的基本原理 制备DNA片段,并通过载体将其导入受体细胞,在受体细胞中复制、扩增,以获得单一DNA分子的大量拷贝。 五、重组DNA技术的基本过程 (一)制备目的基因和载体; (二)DNA的重组; (三)重组DNA导入宿主细胞 (四)DNA重组体的筛选和鉴定 (五)DNA重组体的 扩增和表达 (一)目的基因的 制备: 目的基因的筛选和分离可采用以下方法进行: 1.直接从染色体DNA中分离: 仅适用于原核生物基因的分离,较少采用。 2.人工合成: 根据已知多肽链的氨基酸顺序,利用遗传密码表推定其核苷酸顺序再进行人工合成。适应于编码小分子多肽的基因。 3.从mRNA合成cDNA: 采用一定的方法钓取特定基因的mRNA,再通过逆转录酶催化合成其互补DNA(cDNA),除去RNA链后,再用DNA聚合酶合成其互补DNA链,从而得到双链DNA。这一方法通常可得到可表达的完整基因。 4.从基因文库中筛选: 将某一种基因DNA用适当的限制酶切断后,与载体DNA重组,再全部转化宿主细胞,得到含全部基因组DNA的种群,称为G文库(genomic DNA library)。 将某种细胞的全部mRNA通过逆转合成cDNA,然后转化宿主细胞,得到含全部表达基因的种群,称为C-文库(cDNA library)。C-文库具有组织细胞特异性。 5.利用PCR合成: (聚合酶链反应) 如已知目的基因两端的序列,则可采用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)技术,在体外合成目的基因。 (二)目的基因与载体连接(DNA的重组) 主要通过DNA连接酶和双链DNA粘性末端序列互补结合。 1、粘性末端连接 利用同种限制性内切酶切开载体和DNA分子,能产生相同的粘性末端,在T4连接酶作用下遍可互补。 2、同聚物加尾连接 在酶的催化下人为在DNA链3‘末端添加多聚脱氧单核苷酸,制造粘性末端。 3、平末端连接 在 T4 DNA连接酶的作用下,直接连接DNA平端末端,效率较低。 4、人工接头连接 在平端DNA末尾加上人工合成的具有限制性DN
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