随机扩增多态性DNA技术对湘产蛇莓种质资源的遗传多样性.PDF

随机扩增多态性DNA 技术对湘产蛇莓种质资源的遗传多样性分 析Δ ＊ # 刘湘丹 ，高 昱，张亚利，蔡嘉洛，童巧珍，张聪子（湖南中医药大学药学院，长沙 410208） 中图分类号 S567.2 文献标志码 A 文章编号 1001-0408（2015）19-2628-04 DOI 10.6039/j.issn. 1001-0408.2015.19.11 摘 要 目的：研究湘产蛇莓种质资源的遗传多样性。方法：建立不同地理分布的蛇莓种质资源随机扩增多态性DNA （RAPD ）反 应体系，RAPD-聚合酶链反应（PCR ）法检测湘产24组蛇莓样本（21个野生品，3个栽培品），琼脂糖凝胶电泳分析结果，计算等位基 因数（Na ）、有效等位基因数（Ne ）、多态性位点百分比（PPB）、Nei ’s 基因多样性指数（H）、Shannon’s信息指数（I）。结果：筛选出多态性 引物14条，共扩增出90条电泳谱带，其中多态带为81条，Na 为1.9000，Ne 为1.5401，PPB 为90.0％，H 为0.3128，I 为0.4675。结论： 湘产蛇莓各区域样本间遗传多样性丰富，人工栽培品与野生品之间存在遗传背景上的差异，聚类结果与地理分布表现出明显相关性。 关键词 蛇莓；种质资源；随机扩增多态性脱氧核糖核酸；遗传多样性；聚类分析；聚合酶链反应 Analysis of the Genetic Diversity of Germplasm Resources of Duchesnea indica from Hunan by Random Amplified Polymorphic DNA LIU Xiang-dan ，GAO Yu ，ZHANG Ya-li ，CAI Jia-luo ，TONG Qiao-zhen ，ZHANG Cong-zi （School of Pharmacy ， Hunan University of Chinese Medicine ，Changsha 410208，China ） ABSTRACT OBJECTIVE ：To study the genetic diversity of germplasm resources of Duchesnea indica from Hunan. METHODS ： The random amplified polymorphic DNA （RAPD ）reaction system of germplasm resources was established and RAPD-PCR was ad- opted to detect the expressions of 24 groups of D. indica from Hunan （including 21wild and 3 cultivated varietos in different geo- graphical distribution ）. Agarose gel electrophoresis was used to analyze the results and calculate allele number （Na ），effective al- lele number （Ne ）the polymorphism points percentage （PPB ），Nei ’s gene diversity index （H ）and Shannon ’s information index （I ）. RESULTS ：Totally 14polymorphic primers were screened and 90 electrophoresis bands were amplified ，including 81polymor- phic bands with Na of 1.900 0，Ne of 1.540 1，PPB of 90.0％，H of 0.3128and I of 0.467 5. CONCLUSIONS ：The genetic diver- sity of D. indica from Hunan is rich ，and there were differences in gen