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肿瘤靶向治疗,基因检验
检测方法/检测灵敏度 100% 50% 5% 1% 0.01% 耗时 费用 直接测序法 +++ ++ - - - 6h 低 Taqman-ARMS? +++ +++ +++ +++ - 1.5h 中等 焦磷酸测序法 +++ ++ + - - 6h 中等 Taqman QPCR技术 +++ +++ +/- - - 2h 中等 EGFR基因突变检测方法灵敏度的比较 测序技术发展历程 Sanger Sequencing (1977) Ion Semiconductor Sequencing (2011) Next-Gen Sequencing (2005以后) Ion Torrent半导体测序原理 Ion Torrent半导体测序平台及芯片 PI芯片:sequence exomes and whole transcriptomes(5Gb) 肿瘤类型 靶向药物 基因 样本 疗效佳的情况 非小细胞肺癌 易瑞沙(Iressa) 特罗凯(Tarceva) EGFR KRAS 手术/穿刺/ 胸腹水/血浆 EGFR突变/KRAS野生 克唑替尼 EML4-ALK融合 手术/穿刺/ 胸腹水 阳性 胃肠间质瘤 格列卫(Gleevec) C-Kit PDGFRA 手术/穿刺/内镜活检/血浆 C-kit第11外显子突变/PDGFR突变 慢性粒细胞白血病 格列卫(Gleevec) 达沙替尼(Dasatinib) 尼罗替尼(Nilotinib) ABL 骨髓/全血 无T315I突变 乳腺癌 拉帕替尼(Lapatinib) PI3K 手术/穿刺/内镜活检/血浆 野生型 赫塞汀 Her-2 病理切片 高表达/表达阳性 目前成熟的肿瘤分子靶向药物敏感性基因检测 基因表达量(mRNA)检测 ——指导个体化化疗 可使标准化疗方案得到个体化应用 mRNA检测主要技术特色 采用荧光定量PCR技术,采用内参比RNA作为质控对照,应用beta-actin作为内对照,定量检测检测目的基因mRNA表达水平。 适用于各种肿瘤组织检测,包括石蜡标本、穿刺标本、冰冻活检标本等。 国内采用校准RNA(Calibrator RNA)方法进行基因表达定量。 * 基础:5000例样本 人种:中国患者样本 标准:正态分布 定位:精确到1% 统计:p0.05 Q-PCR检测基因表达数据库 NCCN 2012年版临床治疗指南明确指出: 患者接受吉西他滨化疗前进行RRM1 mRNA检测可提高治疗有效率和患者生存率。 RRM1 mRNA No. Patients Median Survival P 1.4 8 15.5 mos 0.0028 1.4 8 6.8 mos RRM1表达与吉西他滨疗效相关的临床数据 ERCC1表达与铂类药物疗效相关的临床数据 ERCC1低表达患者,能从铂类辅助化疗中获益. BRCA1/2表达与铂类药物疗效 相关的临床数据 BRCA1过度表达 铂类耐药的预测因子 抗微管类药物的敏感因子 * 低TS mRNA水平的肿瘤患者接受氟类化疗的效果较好,中位生存期较长。 TS低表达的患者对培美曲赛的疗效好。 TS高表达影响氟类和培美曲塞药效 Shirota Y et al. J Clin Oncol. 2001;19:4298-304 TUBB3高表达对紫杉醇和长春碱类不敏感 TUBB3阳性表达是抗微管类药物敏感预测因子 * STMN1表达检测意义 预后: 表达水平越高,患者的生存率越低,肿瘤发生转移的风险越高。 疗效: 低表达接受长春瑞滨/顺铂治疗的效果较好,中位生存期较长; STMN1高表达接受长春瑞滨/顺铂的疗效较差。 Elizabeth A et al. Cancer Res. 2002;62:6864-6869 ——乳腺癌患者预后指标及曲妥珠单抗治疗的靶点 ——胃癌曲妥珠单抗靶向治疗的靶点 HER2基因检测 FDA 2013年关于胃癌HER2检测流程建议 ASCO/CAP2013指南关于乳腺癌HER2检测推荐: IHC检测HER2蛋白表达水平 FISH检测HER2基因扩增 药物名称 检测靶点 检测内容 靶向药物 贝伐单抗 VEGFR mRNA表达水平,1项 西妥昔单抗 K-ras(2项); B-raf; PIK3CA(2项) 基因突变,5项 EGFR mRNA表达水平,1项 厄洛替尼 EGFR(Exon18/19/20/21); K-ras(2项) ; B-raf 基因突变,7项 曲妥珠单抗 HER-2; PTEN mRNA表达水平,2项 索拉菲尼 PDGFRβ; VEGFR mRNA表达水平,2项 伊马替尼 C-kit (4项); PDGFRα(2项) 基因突变,6项 PDGFRβ mRNA表达水平,1项 舒尼替尼 V
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