人类疾病和基因组研究.pptVIP

* * * * * 2007年年底，在Science上发表了一篇对人结直肠癌和乳腺癌基因组的景观分析的文章， 他们对2万多个转录子进行了突变分析，发现在结直肠癌和乳腺癌中突变频率高的生物途径为PI3k和NFkB. 他们还分别找出了在这两种癌症中突变频率最高的4个基因和两个蛋白蛋白相互作用网络。 * 2007年年底，在Science上发表了一篇对人结直肠癌和乳腺癌基因组的景观分析的文章， 他们对2万多个转录子进行了突变分析，发现在结直肠癌和乳腺癌中突变频率高的生物途径为PI3k和NFkB. 他们还分别找出了在这两种癌症中突变频率最高的4个基因和两个蛋白蛋白相互作用网络。 IHC staining of SPARCL1 and Osteopontin in non-metastastic and liver metastastic CRC. (a) Schematic of SPARCL1 and Osteopontin on non-metastastic CRC and CRC with liver metastases.(b – g) . SPARCL1 in non-metastastic CRC compared to the primary CRC with metstasis (P = 0.004, d versus f). The primary CRC and liver metastases expressed SPARCL1 at similarlevels (P = 0.830, b versus f). SPARCL1 was expressed in adjacent liver tissues (arrows in b). Osteopontin was in liver metastases compared to the primary CRC (P = 0.004, c versus g). No significant differential expressions of Osteopontin were observed between non-metastastic and liver metastastic CRC (P = 0.159, e versus g) 胡涵光，2009；虞舒静，2008 SPARCL1与生存时间 SPARCL1 表达水平与生存时间显著相关 （P = 0.025） 表达水平高者，预后好。 葛维挺， 虞舒静， SPARCL1与生存时间 将SPARCL1表达水平分为 high和low两组，可更好判断预后（P=0.008） IV期病人中SPARCL1高表达者仅3例，但预后明显好于低表达者。 葛维挺， 胡涵光，虞舒静， P53/SPARC 模型 中位 PFS 预后好 (预示=0) 91.676 m 预后差 (预示=1) 41.928 m Sampling: Selection sample with suitable phenotype matching the study purpose Sufficiency clinic information: Clinic-pathologic phenotype Sample handling: Storage, shipping, preparing… Bio-informatics Multi-Disciplines Analysis High throughput Sequencing Thank you! 大肠癌干细胞研究 郑 树 朱永良 史 钟 王荣富 浙江大学肿瘤研究所，医学院附属第二医院 恶性肿瘤预警与干预教育部重点实验室 zhengshu@zju.edu.cn, 0571郑州，2010-4-24 研究背景 大肠癌发生源于干细胞（crypt）突变 c 遗传相关性大肠癌 APC突变引起FAP，Gardner综合症， hMLH1，hMSH2突变HNPCC等。 散发性大肠癌 来源于大肠干细胞突变的不断累积。 第一部分 永生化的大肠干细胞(cry