原发性肝细胞癌中HBVDNA整合位点分析.PDFVIP

2011 3 1 56 ●临床研究● 《中国医学前沿杂志（电子版）》 年 第卷 第期 原发性肝细胞癌中HBV DNA整合位点分析 1，2 1 1 1 1 1 蒋素贞 ，杨紫伟，李韦杰，李晓君，陈香梅，鲁凤民 （1.北京大学医学部 病原生物学系， 北京 100191；2.南方医科大学附属南方医院 感染内科，广州 510515） 【摘要】　 目的　比较乙型肝炎病毒 （HBV ）基因在原发性肝细胞癌及癌旁组织中的整合规律， 探讨其致癌作用机制。方法　采用Alu-PCR和LM-PCR方法扩增50例有慢性HBV感染背景的肝癌 组织及配对非肿瘤肝组织的HBV整合片段，并对整合位点侧翼的病毒及人基因组DNA序列进行测 序，通过NCBI BIAST及UCSC BLAT检索确定HBV DNA在染色体上的精确整合位置。结果　50例 肝癌组织中有34例标本检测到HBV DNA 的整合，癌组织HBV DNA 的整合检出率为68% ；配对癌 旁组织有35例标本检测到HBV DNA 的整合，整合检出率为70% 。癌组织中的所有染色体上都检测 到HBV整合位点，癌旁组织中除了Y染色体之外，其余染色体也都检测到整合位点。其中14号、 15号、18号、19号、Y染色体的HBV DNA 整合密度在癌组织中高于癌旁组织。结论　癌组织中14 号、15号、18号、19号和Y染色体的HBV DNA整合频率高于癌旁组织，整合位点附近有与癌症相 关的基因，提示HBV DNA在这些染色体上的整合可能与HBV致癌机制有一定相关性。 【关键词】　原发性肝细胞癌；乙肝病毒；整合；染色体 Analysis on hepatitis B virus (HBV) DNA integration sites in JIANG Su-zhen1,2 1 1 1 1 1 , YANG Zi-wei , LI Wei-jie , LI Xiao-jun , CHEN Xiang-mei , LU Feng-min 1.Department of Microbiology, Peking University Health Science Center, Beijing 100191, China; 2.Department of Infection, Nanfang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou 510515, China Corresponding author: CHEN Xiang-mei, Email: xm_chen6176@bjmu.edu.cn; LU Feng-min, Email: lu.fengmin@hsc.pku.edu.cn It has been known that hepatitis B virus (HBV) DNA integrates into or close to human AbstrSaucbtject 【 】 genes in primary hepatocellular carcinomas (HCC) and peficancerous tissues frequently. Our research aims at figuring out its regulations and carcinogenesis. Alu-PCR and LM-PCR are adopted to amplify the Methods HBV integration sequences and its flank sequences of human. After full-automatic sequencing, we analyze the data by NCBI BLAST and UCSC BLAT to locate the